More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0336 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  100 
 
 
441 aa  907    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  34.49 
 
 
471 aa  266  4e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  35.19 
 
 
464 aa  265  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  34.95 
 
 
464 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  32.59 
 
 
467 aa  261  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  33.64 
 
 
469 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  32.44 
 
 
477 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  33.33 
 
 
463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  31.91 
 
 
472 aa  254  3e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  31.11 
 
 
469 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  30.11 
 
 
475 aa  253  6e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  29.82 
 
 
467 aa  249  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  32.74 
 
 
499 aa  249  8e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  31.35 
 
 
468 aa  249  8e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  31.85 
 
 
465 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  32.24 
 
 
469 aa  248  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  31.85 
 
 
465 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  31.53 
 
 
465 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  30.8 
 
 
473 aa  248  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  31.84 
 
 
465 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  32.07 
 
 
465 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  31.63 
 
 
465 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  31.63 
 
 
465 aa  247  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  31.63 
 
 
465 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  31.63 
 
 
465 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  31.77 
 
 
463 aa  247  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  31.63 
 
 
465 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  31.39 
 
 
475 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  31.63 
 
 
465 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  33.1 
 
 
474 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  31.36 
 
 
470 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  31.53 
 
 
465 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  31.24 
 
 
472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  30.32 
 
 
471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  31.28 
 
 
465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  31.69 
 
 
487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  31.46 
 
 
470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  31.01 
 
 
482 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  31.24 
 
 
470 aa  244  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  32.13 
 
 
479 aa  244  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  31.84 
 
 
490 aa  243  3.9999999999999997e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  32.42 
 
 
466 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  31.24 
 
 
470 aa  243  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  30.87 
 
 
470 aa  242  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  31.76 
 
 
465 aa  242  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  32.14 
 
 
483 aa  242  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  31.76 
 
 
465 aa  242  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  31.76 
 
 
465 aa  242  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  31.01 
 
 
487 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  30.11 
 
 
479 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  30.56 
 
 
481 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  30.56 
 
 
480 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  31.46 
 
 
485 aa  240  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  29.89 
 
 
479 aa  239  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  30.56 
 
 
485 aa  239  5.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  30.56 
 
 
485 aa  239  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  30.34 
 
 
470 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  31.46 
 
 
470 aa  239  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  31.01 
 
 
470 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  29.84 
 
 
476 aa  237  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  29.91 
 
 
487 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  29.91 
 
 
487 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  29.91 
 
 
487 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  29.36 
 
 
476 aa  237  4e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  31.66 
 
 
466 aa  236  4e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  30.11 
 
 
481 aa  236  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  29.63 
 
 
476 aa  236  5.0000000000000005e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  30.56 
 
 
552 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  30.79 
 
 
481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  32.59 
 
 
483 aa  234  3e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  29.54 
 
 
476 aa  234  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  30.37 
 
 
470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  30.56 
 
 
475 aa  233  7.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  29.02 
 
 
469 aa  232  1e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  31.25 
 
 
470 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  30.44 
 
 
470 aa  231  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  30.24 
 
 
472 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  29.03 
 
 
472 aa  231  3e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  30.28 
 
 
488 aa  230  4e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  31.01 
 
 
470 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  30.8 
 
 
470 aa  230  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  30.8 
 
 
472 aa  230  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  30.29 
 
 
471 aa  229  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  30.34 
 
 
479 aa  229  8e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  31.65 
 
 
479 aa  229  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1206  FeS assembly protein SufB  30.52 
 
 
470 aa  227  3e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0384919  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  30.16 
 
 
471 aa  227  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  31.46 
 
 
478 aa  227  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  31.01 
 
 
482 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  29.69 
 
 
476 aa  226  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  29.91 
 
 
471 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  29.48 
 
 
471 aa  225  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  29.24 
 
 
476 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.11 
 
 
469 aa  224  3e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  29.21 
 
 
477 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1078  FeS assembly protein SufB  32.95 
 
 
471 aa  221  3e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000122877  normal  0.697067 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0613  FeS assembly protein SufB  30.72 
 
 
473 aa  219  7e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1745  FeS assembly protein SufB  30.11 
 
 
474 aa  218  2e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0726  FeS assembly protein SufB  30.96 
 
 
489 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.85 
 
 
472 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>