More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1907 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1907  FeS assembly protein SufD  100 
 
 		 384 aa  773    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1656  SufBD protein  41.69 
 
 		 378 aa  300  3e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1839  SufBD protein  29.28 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1169  SufBD protein  24.8 
 
 		 370 aa  99.4  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.038096  normal  0.786569 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  30.1 
 
 		 466 aa  86.3  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0132  SufBD protein  22.13 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0125  hypothetical protein  23.88 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0190029  hitchhiker  0.00579103 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0812  FeS assembly protein SufD  25.86 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0156327  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  29.61 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  35.07 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0085  hypothetical protein  21.59 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4269  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  34.56 
 
 		 482 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2443  FeS assembly protein SufD  34.19 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.83747  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1001  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  32.84 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  25.11 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  28.78 
 
 		 552 aa  77.4  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01979  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  33.85 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16322  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  34.56 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0636  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  34.62 
 
 		 482 aa  76.3  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0652  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  34.62 
 
 		 482 aa  76.3  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  34.85 
 
 		 469 aa  76.3  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0440  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  33.58 
 
 		 513 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119896  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0729  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  32.84 
 
 		 485 aa  75.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0818  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  32.84 
 
 		 485 aa  75.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2094  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  33.58 
 
 		 509 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0260072  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_002620  TC0056  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  32.09 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  32.81 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  32.09 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  30.3 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2362  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  32.84 
 
 		 509 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3082  FeS assembly protein SufD  24.5 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0565637  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  32.03 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2490  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  33.58 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5848  FeS assembly protein SufB  33.33 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.843963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2364  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  33.09 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.094709  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  31.34 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0992  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  35.38 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3040  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  32.84 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.128199 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2022  FeS assembly protein SufB  36.03 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126519  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1136  FeS assembly protein SufD  27.55 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0309349 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3964  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  32.84 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00244471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  28.79 
 
 		 470 aa  73.9  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  31.34 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5109  FeS assembly protein SufB  33.33 
 
 		 489 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136802 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  27.45 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  27.45 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  21.74 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2822  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  33.33 
 
 		 484 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2703  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  33.33 
 
 		 484 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2760  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  33.33 
 
 		 484 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  29.85 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1192  FeS assembly protein SufB  33.33 
 
 		 499 aa  72.4  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0017395  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11489  hypothetical protein  25.25 
 
 		 846 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000249036  normal  0.700584 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1502  SufBD protein  23.56 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2588  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  31.06 
 
 		 489 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.386299  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  26.34 
 
 		 470 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1242  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  32.31 
 
 		 506 aa  72  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4457  FeS assembly protein SufB  33.85 
 
 		 489 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985425  normal  0.145425 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  30.6 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16140  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  33.87 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  26.85 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0424  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  32.84 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.746607  normal  0.0638657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.85 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  35.25 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1313  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.61 
 
 		 491 aa  71.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00972882  normal  0.48939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  25.37 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  25.85 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  26.45 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  27.1 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4345  FeS assembly protein SufB  33.85 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1664  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  31.06 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0579  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  29.8 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00207059  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  27.1 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1631  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  31.54 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190869  hitchhiker  0.0000799616 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  25.25 
 
 		 490 aa  70.5  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  25.29 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  33.58 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  26.45 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1448  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  33.58 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2854  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  31.21 
 
 		 497 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0556902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0694  FeS assembly protein SufB  33.85 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.415749  normal  0.0650499 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  26.45 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  25.95 
 
 		 470 aa  70.1  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1508  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  32.84 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0755494 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2920  SufBD protein  24.49 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.689124  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  26.8 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2841  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  31.06 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04440  hypothetical protein  32.82 
 
 		 481 aa  70.1  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30977  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0378  SufBD protein  25.75 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0643358  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  29.1 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  25.3 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1661  FeS assembly protein SufD  36.61 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.249285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2328  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  31.06 
 
 		 493 aa  69.7  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  24.75 
 
 		 481 aa  69.7  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2343  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  31.21 
 
 		 497 aa  69.7  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141786  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00811  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  32.84 
 
 		 482 aa  69.7  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2384  FeS assembly protein SufD  36.7 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  26.45 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14630  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  31.17 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2255  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  32.09 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>