More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0056 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0056  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  100 
 
 
483 aa  1006    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3450  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.02 
 
 
479 aa  638    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00551493  hitchhiker  0.00000000835883 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0652  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  64.71 
 
 
482 aa  644    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0636  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  64.71 
 
 
482 aa  647    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0424  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  61.98 
 
 
479 aa  635    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.746607  normal  0.0638657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0415  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.02 
 
 
480 aa  636    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4729  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.64 
 
 
480 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0426  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.22 
 
 
480 aa  638    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1735  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.81 
 
 
479 aa  632  1e-180  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0796  FeS assembly protein SufB  61.57 
 
 
479 aa  629  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300367  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0075  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63 
 
 
480 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3040  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  61.86 
 
 
481 aa  625  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.128199 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00851  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63 
 
 
480 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.927009  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00841  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63 
 
 
500 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0696  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  61.47 
 
 
478 aa  621  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408407  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3151  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  61.09 
 
 
482 aa  621  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.347043  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1436  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.29 
 
 
480 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0910011  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2490  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.71 
 
 
482 aa  618  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0843  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  61.22 
 
 
479 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177229  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0978  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.63 
 
 
481 aa  618  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.231871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1344  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.74 
 
 
478 aa  619  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.430599  hitchhiker  0.000000189846 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01371  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.08 
 
 
480 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0889  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.8 
 
 
479 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.741198  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0404  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.25 
 
 
479 aa  616  1e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16322  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  62.55 
 
 
471 aa  616  1e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4355  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  61.47 
 
 
478 aa  617  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.365891  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0725  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  61.36 
 
 
482 aa  615  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0903  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  61.05 
 
 
479 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698601  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00821  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.13 
 
 
480 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.795563  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03021  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.84 
 
 
480 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0893  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.59 
 
 
479 aa  614  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0992  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  61.47 
 
 
481 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2918  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.89 
 
 
490 aa  612  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.581935 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1170  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60 
 
 
481 aa  611  9.999999999999999e-175  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.444393 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00811  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  61.49 
 
 
482 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2282  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.04 
 
 
479 aa  611  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342461  normal  0.152729 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1414  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  61.22 
 
 
479 aa  610  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.80589  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3608  FeS assembly protein SufB  58.59 
 
 
497 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.93243 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3309  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.09 
 
 
496 aa  605  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.218946  normal  0.0498365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1860  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.42 
 
 
478 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01357  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.34 
 
 
478 aa  606  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.456258  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1192  FeS assembly protein SufB  59.26 
 
 
499 aa  607  9.999999999999999e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0017395  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2575  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.58 
 
 
481 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0257  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.72 
 
 
481 aa  602  1.0000000000000001e-171  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3284  FeS assembly protein SufB  59.29 
 
 
479 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0195  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.47 
 
 
493 aa  603  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2364  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.08 
 
 
508 aa  603  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.094709  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1184  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.16 
 
 
482 aa  599  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  61.1 
 
 
480 aa  600  1e-170  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1448  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  61.1 
 
 
484 aa  601  1e-170  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2573  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  58.9 
 
 
484 aa  598  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4269  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.79 
 
 
482 aa  598  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0332  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.29 
 
 
490 aa  601  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1233  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.41 
 
 
480 aa  599  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.737377  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0674  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.7 
 
 
495 aa  598  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.384058 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04440  hypothetical protein  58.87 
 
 
481 aa  601  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30977  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2022  FeS assembly protein SufB  60.08 
 
 
486 aa  599  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126519  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2272  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.79 
 
 
483 aa  596  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2362  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.54 
 
 
509 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362796  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1508  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  58.96 
 
 
483 aa  596  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0755494 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2094  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.54 
 
 
509 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0260072  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3262  FeS assembly protein SufB  58.69 
 
 
482 aa  593  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47258  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2343  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  58.51 
 
 
497 aa  593  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2854  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  58.3 
 
 
497 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0556902  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1899  FeS assembly protein SufB  59.92 
 
 
502 aa  594  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01979  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.75 
 
 
485 aa  588  1e-167  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4457  FeS assembly protein SufB  59.28 
 
 
489 aa  589  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985425  normal  0.145425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0694  FeS assembly protein SufB  59.07 
 
 
489 aa  588  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.415749  normal  0.0650499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1781  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  57 
 
 
503 aa  589  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2435  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.41 
 
 
489 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3964  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.04 
 
 
508 aa  588  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00244471  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2107  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  58.46 
 
 
489 aa  588  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862611  normal  0.0704835 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1468  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.2 
 
 
489 aa  589  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454398  normal  0.0337836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2588  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  57.68 
 
 
489 aa  590  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.386299  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0539  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  58.46 
 
 
491 aa  590  1e-167  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1900  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  58.46 
 
 
489 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000572283 
 
 
-
 
NC_004310  BR0931  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  56.97 
 
 
507 aa  585  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122156  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2255  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  57.37 
 
 
507 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0729  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.75 
 
 
485 aa  585  1e-166  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1797  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  57.81 
 
 
630 aa  585  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3977  FeS assembly protein SufB  58.86 
 
 
489 aa  585  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.229851  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1631  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  58.25 
 
 
503 aa  585  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190869  hitchhiker  0.0000799616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4469  FeS assembly protein SufB  58.09 
 
 
490 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0925  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  56.97 
 
 
507 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3966  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  57.88 
 
 
498 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0440  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  58.44 
 
 
513 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119896  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2841  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  58.07 
 
 
493 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205273  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2328  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  58.07 
 
 
493 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1313  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  57.41 
 
 
491 aa  582  1.0000000000000001e-165  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00972882  normal  0.48939 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0818  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.53 
 
 
485 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4345  FeS assembly protein SufB  58.65 
 
 
489 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3355  FeS assembly protein SufB  59.37 
 
 
481 aa  579  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499735  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5931  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  56.45 
 
 
506 aa  581  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1001  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  57.85 
 
 
491 aa  579  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.260746 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1664  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  57.86 
 
 
493 aa  580  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2822  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  57.17 
 
 
484 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2456  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  57.23 
 
 
493 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1608  FeS assembly protein SufB  57.29 
 
 
490 aa  580  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0033027 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1242  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  56.94 
 
 
506 aa  581  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0084  FeS assembly protein SufB  58.16 
 
 
494 aa  580  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.597876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>