More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0257 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0889  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  72.15 
 
 
479 aa  737    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.741198  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1959  FeS assembly protein SufB  62.28 
 
 
495 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2255  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  68.6 
 
 
507 aa  722    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2397  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.28 
 
 
495 aa  650    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.357216  hitchhiker  0.000650358 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16322  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  71.67 
 
 
471 aa  708    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0257  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  100 
 
 
481 aa  1000    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3262  FeS assembly protein SufB  71.73 
 
 
482 aa  726    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47258  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1761  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.62 
 
 
495 aa  645    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5109  FeS assembly protein SufB  68.58 
 
 
489 aa  712    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0992  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  71.73 
 
 
481 aa  744    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2742  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  66.94 
 
 
493 aa  707    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.970573  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1448  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  72.8 
 
 
484 aa  737    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2362  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  67.63 
 
 
509 aa  704    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362796  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  72.8 
 
 
480 aa  736    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0931  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  67.6 
 
 
507 aa  716    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122156  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01979  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  66.94 
 
 
485 aa  694    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0925  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  67.4 
 
 
507 aa  713    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1467  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.48 
 
 
495 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149151  normal  0.114859 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00811  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  68.54 
 
 
482 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1001  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  67.22 
 
 
491 aa  697    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.260746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2918  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  71.52 
 
 
490 aa  723    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.581935 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0652  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  72.2 
 
 
482 aa  755    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1948  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.28 
 
 
495 aa  649    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000269575 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0636  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  72.61 
 
 
482 aa  755    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1513  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.08 
 
 
495 aa  649    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2588  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  65.85 
 
 
489 aa  686    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.386299  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1436  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  68.34 
 
 
480 aa  700    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0910011  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1184  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  72.03 
 
 
482 aa  721    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1664  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  67.14 
 
 
493 aa  713    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0424  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  72.16 
 
 
479 aa  721    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.746607  normal  0.0638657 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2822  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  66.17 
 
 
484 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2490  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  72 
 
 
482 aa  757    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0440  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  66.87 
 
 
513 aa  693    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119896  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0404  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  69.7 
 
 
479 aa  706    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2282  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  70.13 
 
 
479 aa  712    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342461  normal  0.152729 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0579  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.75 
 
 
496 aa  655    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00207059  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4457  FeS assembly protein SufB  68.58 
 
 
489 aa  709    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985425  normal  0.145425 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0729  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  67.57 
 
 
485 aa  697    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0075  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  66.32 
 
 
480 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1735  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  73.45 
 
 
479 aa  734    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0696  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  68.21 
 
 
478 aa  701    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408407  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2272  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  70.69 
 
 
483 aa  729    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2573  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  70.25 
 
 
484 aa  736    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1797  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  66.6 
 
 
630 aa  691    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0843  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  71.94 
 
 
479 aa  734    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177229  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3977  FeS assembly protein SufB  68.58 
 
 
489 aa  709    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.229851  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2994  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  66.46 
 
 
498 aa  707    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0195  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  71.19 
 
 
493 aa  716    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2364  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  66.87 
 
 
508 aa  692    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.094709  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1860  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  68.63 
 
 
478 aa  702    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1414  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  69.47 
 
 
479 aa  713    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.80589  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2841  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  67.89 
 
 
493 aa  715    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205273  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4269  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  72.21 
 
 
482 aa  748    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2760  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  65.95 
 
 
484 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1631  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  66.81 
 
 
503 aa  691    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190869  hitchhiker  0.0000799616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2456  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  66.73 
 
 
493 aa  705    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1233  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  69.89 
 
 
480 aa  722    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.737377  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2328  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  67.35 
 
 
493 aa  714    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0796  FeS assembly protein SufB  71.73 
 
 
479 aa  720    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0903  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  72.57 
 
 
479 aa  744    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698601  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3309  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  67.41 
 
 
496 aa  716    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.218946  normal  0.0498365 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1242  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  66.19 
 
 
506 aa  692    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0674  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  71.25 
 
 
495 aa  724    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.384058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1900  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  69.75 
 
 
489 aa  724    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000572283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3966  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  66.46 
 
 
498 aa  708    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01357  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  69.89 
 
 
478 aa  711    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.456258  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1781  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  67.6 
 
 
503 aa  714    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0978  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  74.64 
 
 
481 aa  773    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.231871 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4355  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  71.67 
 
 
478 aa  704    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.365891  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0725  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  69.71 
 
 
482 aa  718    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1313  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  66.24 
 
 
491 aa  672    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00972882  normal  0.48939 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1764  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.28 
 
 
495 aa  649    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.135564  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5931  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  66.6 
 
 
506 aa  714    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1170  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  74.43 
 
 
481 aa  764    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.444393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0084  FeS assembly protein SufB  68.76 
 
 
494 aa  704    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.597876 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0098  FeS assembly protein SufB  67.14 
 
 
506 aa  707    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.782387 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1899  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.08 
 
 
495 aa  648    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0214844  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1483  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.48 
 
 
495 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000585314 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2703  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  66.38 
 
 
484 aa  684    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00841  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  67.36 
 
 
500 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1899  FeS assembly protein SufB  70.09 
 
 
502 aa  718    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3964  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  68.33 
 
 
508 aa  699    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00244471  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1344  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  69.89 
 
 
478 aa  714    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.430599  hitchhiker  0.000000189846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4469  FeS assembly protein SufB  70.32 
 
 
490 aa  717    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1468  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  69.75 
 
 
489 aa  722    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454398  normal  0.0337836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0694  FeS assembly protein SufB  68.58 
 
 
489 aa  709    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.415749  normal  0.0650499 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1508  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  67.43 
 
 
483 aa  713    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0755494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1502  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.28 
 
 
495 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.981811  hitchhiker  0.00000181551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3151  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  71.16 
 
 
482 aa  738    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.347043  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2854  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  67.37 
 
 
497 aa  697    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0556902  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0810  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  67 
 
 
503 aa  709    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0422857  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1801  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.48 
 
 
495 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0601215  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1608  FeS assembly protein SufB  68.17 
 
 
490 aa  711    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0033027 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0539  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  68.36 
 
 
491 aa  712    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00851  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  67.15 
 
 
480 aa  684    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.927009  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00821  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  66.39 
 
 
480 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.795563  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01371  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  68.34 
 
 
480 aa  700    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03021  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  68.01 
 
 
480 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1972  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.48 
 
 
495 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000399333 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2094  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  67.84 
 
 
509 aa  705    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0260072  normal  0.816164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>