More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1860 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0889  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  72.57 
 
 		 479 aa  735    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.741198  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1959  FeS assembly protein SufB  63.05 
 
 		 495 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2742  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  65.5 
 
 		 493 aa  687    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.970573  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3309  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  70.16 
 
 		 496 aa  734    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.218946  normal  0.0498365 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00841  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  68.84 
 
 		 500 aa  715    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0257  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  68.63 
 
 		 481 aa  690    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3262  FeS assembly protein SufB  70.09 
 
 		 482 aa  718    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2272  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  72.1 
 
 		 483 aa  729    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1001  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  68.78 
 
 		 491 aa  700    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260746 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0992  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  71.94 
 
 		 481 aa  740    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1170  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  69.89 
 
 		 481 aa  718    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.444393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2918  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  68.43 
 
 		 490 aa  704    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.581935 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1761  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.26 
 
 		 495 aa  643    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337017 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1608  FeS assembly protein SufB  66.31 
 
 		 490 aa  674    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0033027 
 
 
-
 
NC_004310  BR0931  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  66.05 
 
 		 507 aa  694    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122156  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0729  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  68.63 
 
 		 485 aa  687    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1467  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.05 
 
 		 495 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149151  normal  0.114859 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01979  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  68.84 
 
 		 485 aa  694    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0694  FeS assembly protein SufB  66.1 
 
 		 489 aa  669    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.415749  normal  0.0650499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4457  FeS assembly protein SufB  66.1 
 
 		 489 aa  668    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985425  normal  0.145425 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0925  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  65.85 
 
 		 507 aa  691    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0652  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  69.87 
 
 		 482 aa  718    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0636  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  70.29 
 
 		 482 aa  718    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5109  FeS assembly protein SufB  66.53 
 
 		 489 aa  675    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136802 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1436  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  69.18 
 
 		 480 aa  729    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0910011  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1184  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  66.67 
 
 		 482 aa  684    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1664  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  65.68 
 
 		 493 aa  684    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0424  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  77.45 
 
 		 479 aa  797    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.746607  normal  0.0638657 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2822  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  65.26 
 
 		 484 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2490  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  72 
 
 		 482 aa  738    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0440  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.77 
 
 		 513 aa  665    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.119896  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0404  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  73.38 
 
 		 479 aa  753    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2282  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  73.17 
 
 		 479 aa  751    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342461  normal  0.152729 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0579  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.71 
 
 		 496 aa  649    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00207059  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1502  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.05 
 
 		 495 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.981811  hitchhiker  0.00000181551 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0903  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  73 
 
 		 479 aa  741    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0075  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  69.05 
 
 		 480 aa  716    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1735  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  78.5 
 
 		 479 aa  798    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0696  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  87.45 
 
 		 478 aa  887    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408407  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16322  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  70.28 
 
 		 471 aa  721    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2573  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  71 
 
 		 484 aa  733    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1797  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  65.26 
 
 		 630 aa  677    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0843  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  72.78 
 
 		 479 aa  737    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177229  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00811  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  70.82 
 
 		 482 aa  722    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2994  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  65.03 
 
 		 498 aa  684    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0195  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  67.8 
 
 		 493 aa  698    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2364  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.12 
 
 		 508 aa  656    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.094709  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1860  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  100 
 
 		 478 aa  999    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1414  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  72.42 
 
 		 479 aa  733    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.80589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2841  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  65.68 
 
 		 493 aa  686    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4269  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  71.58 
 
 		 482 aa  744    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2362  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  65.34 
 
 		 509 aa  681    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2456  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  65.68 
 
 		 493 aa  683    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1233  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  71.34 
 
 		 480 aa  730    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.737377  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2328  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  65.47 
 
 		 493 aa  683    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2397  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.05 
 
 		 495 aa  640    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.357216  hitchhiker  0.000650358 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1764  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.05 
 
 		 495 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.135564  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  72.36 
 
 		 480 aa  731    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1242  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.71 
 
 		 506 aa  657    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0674  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  68.86 
 
 		 495 aa  707    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.384058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3977  FeS assembly protein SufB  65.25 
 
 		 489 aa  666    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.229851  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5931  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  65.57 
 
 		 506 aa  691    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1483  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.05 
 
 		 495 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000585314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1781  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  67.63 
 
 		 503 aa  700    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0978  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  72.42 
 
 		 481 aa  744    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.231871 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4355  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  76.78 
 
 		 478 aa  792    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.365891  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0725  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  69.33 
 
 		 482 aa  712    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1313  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  64.24 
 
 		 491 aa  667    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00972882  normal  0.48939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0084  FeS assembly protein SufB  62.88 
 
 		 494 aa  661    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.597876 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1513  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.84 
 
 		 495 aa  639    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205188 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0796  FeS assembly protein SufB  76.2 
 
 		 479 aa  786    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300367  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1900  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  69.21 
 
 		 489 aa  695    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000572283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4469  FeS assembly protein SufB  69.83 
 
 		 490 aa  709    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2760  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  65.05 
 
 		 484 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0818  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  68.42 
 
 		 485 aa  686    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1899  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.84 
 
 		 495 aa  638    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0214844  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0098  FeS assembly protein SufB  64.34 
 
 		 506 aa  682    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.782387 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2255  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  66.26 
 
 		 507 aa  696    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1631  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  64.79 
 
 		 503 aa  679    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190869  hitchhiker  0.0000799616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1948  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.05 
 
 		 495 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000269575 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3964  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.33 
 
 		 508 aa  665    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00244471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1344  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  69.73 
 
 		 478 aa  720    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.430599  hitchhiker  0.000000189846 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1448  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  72.36 
 
 		 484 aa  731    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1468  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  67.49 
 
 		 489 aa  699    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454398  normal  0.0337836 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1899  FeS assembly protein SufB  72.88 
 
 		 502 aa  742    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1508  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  68.63 
 
 		 483 aa  701    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0755494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2588  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  64.42 
 
 		 489 aa  676    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.386299  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3151  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  69.68 
 
 		 482 aa  725    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.347043  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2854  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  68.21 
 
 		 497 aa  693    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0556902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0810  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  64.33 
 
 		 503 aa  669    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0422857  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1801  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.05 
 
 		 495 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0601215  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0539  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  68.11 
 
 		 491 aa  694    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00851  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  69.05 
 
 		 480 aa  718    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.927009  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00821  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  69.26 
 
 		 480 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.795563  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01371  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  69.39 
 
 		 480 aa  731    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03021  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  70.97 
 
 		 480 aa  723    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1972  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.05 
 
 		 495 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000399333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3966  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  66.88 
 
 		 498 aa  694    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2094  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  64.93 
 
 		 509 aa  677    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0260072  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01357  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  69.1 
 
 		 478 aa  713    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.456258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>