85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0125 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0125  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  723    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0190029  hitchhiker  0.00579103 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1169  SufBD protein  70.81 
 
 		 370 aa  537  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.038096  normal  0.786569 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0132  SufBD protein  70.41 
 
 		 369 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0085  hypothetical protein  66.01 
 
 		 381 aa  429  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1839  SufBD protein  33.8 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1907  FeS assembly protein SufD  23.88 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1656  SufBD protein  23.05 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2551  FeS assembly protein SufD  28.47 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  23.24 
 
 		 435 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  23.24 
 
 		 435 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  22.54 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1672  FeS assembly protein SufD  26.03 
 
 		 434 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  24.66 
 
 		 470 aa  54.7  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0384  FeS assembly protein SufD  20.36 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  23.43 
 
 		 441 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1136  FeS assembly protein SufD  27.04 
 
 		 407 aa  53.9  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0309349 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11500  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  24.28 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165027  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2277  FeS assembly protein SufD  25.91 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000190634  normal  0.0281523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5153  FeS assembly protein SufD  24.46 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  23.66 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13350  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  26.25 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  22.79 
 
 		 463 aa  51.2  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1207  SufBD protein  23.37 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.124978  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1846  FeS assembly protein SufD  22.98 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000255437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2508  FeS assembly protein SufD  24.38 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.62478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  24.07 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14630  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  47.17 
 
 		 440 aa  50.1  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3967  SufBD protein  24.64 
 
 		 448 aa  50.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.835948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2473  FeS assembly protein SufD  35.38 
 
 		 397 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2482  FeS assembly protein SufD  35.38 
 
 		 396 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2916  FeS assembly protein SufD  39.68 
 
 		 410 aa  49.7  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2437  FeS assembly protein SufD  35.38 
 
 		 396 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2065  FeS assembly protein SufD  31.37 
 
 		 440 aa  49.7  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2104  FeS assembly protein SufD  24.82 
 
 		 416 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0056  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  31.31 
 
 		 483 aa  49.3  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  23.53 
 
 		 466 aa  49.3  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  22.94 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  22.3 
 
 		 464 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  25.59 
 
 		 467 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2384  FeS assembly protein SufD  25.41 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1358  FeS assembly protein SufD  39.68 
 
 		 398 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2734  FeS assembly protein SufD  32.31 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2339  FeS assembly protein SufD  39.68 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.187608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2443  FeS assembly protein SufD  25.28 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.83747  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  21.94 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2264  FeS assembly protein SufD  39.62 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3676  FeS assembly protein SufD  32.31 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1141  FeS assembly protein SufD  22.73 
 
 		 407 aa  47.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.303866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21940  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  25.18 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3309  FeS assembly protein SufD  24.82 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000689429 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11490  hypothetical protein  33.85 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106141  normal  0.412126 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0605  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  28.32 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0238111  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3082  FeS assembly protein SufD  24.29 
 
 		 398 aa  46.6  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0565637  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1971  FeS assembly protein SufD  35.82 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.388896 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1140  SufBD protein  21.4 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  21.65 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0892  FeS assembly protein SufD  24.35 
 
 		 429 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  25.87 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  22.59 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  22.96 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5986  FeS assembly protein SufD  35.94 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  24.18 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16140  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  28.89 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  23.05 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  24.78 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  22.59 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  24.78 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  22.96 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0219  hypothetical protein  25.4 
 
 		 420 aa  44.3  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  22.59 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  22.96 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1661  FeS assembly protein SufD  38.1 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.249285  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  22.96 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1986  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  26.26 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  24.86 
 
 		 420 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  22.96 
 
 		 430 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  22.96 
 
 		 430 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2225  FeS assembly protein SufD  27.38 
 
 		 373 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000426532  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0073  ABC transporter, membrane component  23.79 
 
 		 405 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  22.43 
 
 		 430 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  19.35 
 
 		 450 aa  43.1  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00811  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  23.14 
 
 		 482 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  23.13 
 
 		 420 aa  43.1  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01977  FeS assembly protein SufD  27.14 
 
 		 420 aa  43.1  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  27.43 
 
 		 426 aa  42.7  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>