More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1140 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1140  SufBD protein  100 
 
 		 373 aa  753    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0267  SufBD protein  41.03 
 
 		 375 aa  252  8.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0668  FeS assembly protein SufD  38.91 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0654  SufBD protein  29.78 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2330  SufBD protein  32.22 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1638  SufBD protein  28.75 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.822468  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  32.09 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  32.3 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  32.3 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  27.35 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2272  SufBD protein  30.26 
 
 		 481 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  36.22 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2916  FeS assembly protein SufD  24.48 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  36.22 
 
 		 430 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  36.22 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  36.22 
 
 		 430 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  36.22 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  36.22 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  36.22 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  36.22 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  36.22 
 
 		 430 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  36.22 
 
 		 430 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  31.06 
 
 		 435 aa  93.6  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0400  SufBD protein  29.95 
 
 		 379 aa  92.8  9e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.524622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  32.19 
 
 		 436 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  36.22 
 
 		 430 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  29.46 
 
 		 453 aa  90.5  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2430  SufBD protein  25 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  31.51 
 
 		 437 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0049  SufBD protein  36.11 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  30.93 
 
 		 466 aa  87.4  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2037  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  25.52 
 
 		 394 aa  87  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2277  FeS assembly protein SufD  24.28 
 
 		 405 aa  86.7  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000190634  normal  0.0281523 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1502  SufBD protein  24.89 
 
 		 406 aa  86.3  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26800  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  26.9 
 
 		 413 aa  86.3  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0892  FeS assembly protein SufD  27.48 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1846  FeS assembly protein SufD  25.18 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000255437 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11500  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  22.55 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165027  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  27.49 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2920  SufBD protein  26.51 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.689124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  24.07 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0378  SufBD protein  24.89 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0643358  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1113  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  28.89 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185623  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2104  FeS assembly protein SufD  24.46 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  24.38 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  27.4 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1136  FeS assembly protein SufD  26.32 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0309349 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1459  FeS assembly protein SufD  36.3 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  22.54 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  22.13 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  22.83 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  26.34 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  25.12 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  27.39 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  24.17 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  21.09 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.59 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1413  FeS assembly protein SufD  34.81 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  23.97 
 
 		 437 aa  76.3  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  24.53 
 
 		 444 aa  76.3  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0384  FeS assembly protein SufD  23.13 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3309  FeS assembly protein SufD  24.31 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000689429 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.67 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  24.08 
 
 		 448 aa  76.3  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1206  FeS assembly protein SufB  24.44 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0384919  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  26.19 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  26.19 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  22.46 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  21.29 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  21.57 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0219  hypothetical protein  25.65 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12900  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  33.06 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  25.79 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.79 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  0.00000429728 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2443  FeS assembly protein SufD  23.17 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.83747  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  25.79 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.79 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  30.6 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.79 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  25.79 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  27.88 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  23.08 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0987  SufBD protein  25.4 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137837  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3082  FeS assembly protein SufD  24.31 
 
 		 398 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0565637  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2065  FeS assembly protein SufD  23.39 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  25.76 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0605  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  22.22 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0238111  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  22.41 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  22.22 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  21.78 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  32.28 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  23.05 
 
 		 488 aa  70.1  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0174  SufBD protein  23.38 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  22.26 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  24.88 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  24.18 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13350  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  23.14 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  25.11 
 
 		 445 aa  69.7  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  22.26 
 
 		 476 aa  69.7  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  21.45 
 
 		 470 aa  69.7  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>