More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0654 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0654  SufBD protein  100 
 
 		 405 aa  831    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0049  SufBD protein  36.29 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1459  FeS assembly protein SufD  34.16 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1413  FeS assembly protein SufD  33.58 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0267  SufBD protein  27.3 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2330  SufBD protein  32.03 
 
 		 349 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  25.13 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1140  SufBD protein  29.78 
 
 		 373 aa  124  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  23.76 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0668  FeS assembly protein SufD  28.25 
 
 		 375 aa  112  9e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  28.51 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  22.93 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1113  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  27.15 
 
 		 426 aa  109  7.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185623  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2391  FeS assembly protein SufD  29.38 
 
 		 455 aa  109  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2920  SufBD protein  26.24 
 
 		 403 aa  106  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.689124  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  28.79 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  28.79 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  28.4 
 
 		 430 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  28.4 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  28.4 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  28.4 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  28.4 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  28.4 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  28.4 
 
 		 430 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  28.4 
 
 		 430 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0378  SufBD protein  28.73 
 
 		 403 aa  102  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0643358  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0400  SufBD protein  29.74 
 
 		 379 aa  103  8e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.524622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  36.3 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  33.12 
 
 		 435 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26800  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  29.58 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  27.74 
 
 		 446 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2037  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  33.33 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0174  SufBD protein  27.31 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  23.73 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  28.21 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  28.05 
 
 		 466 aa  98.2  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  21.46 
 
 		 444 aa  98.2  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  31.87 
 
 		 435 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  31.87 
 
 		 435 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0219  hypothetical protein  37.76 
 
 		 420 aa  97.1  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  33.13 
 
 		 430 aa  96.7  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  23.69 
 
 		 439 aa  96.7  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  25.13 
 
 		 450 aa  95.9  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2430  SufBD protein  26.67 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0892  FeS assembly protein SufD  32.41 
 
 		 429 aa  94.7  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  24.04 
 
 		 426 aa  94.7  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.83 
 
 		 470 aa  94.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  23.76 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  27.32 
 
 		 467 aa  94  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  41.59 
 
 		 418 aa  94.4  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  23.74 
 
 		 426 aa  94  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  36.36 
 
 		 420 aa  93.6  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1638  SufBD protein  24.71 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.822468  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  22.78 
 
 		 453 aa  93.6  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1502  SufBD protein  27.27 
 
 		 406 aa  93.6  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.8 
 
 		 490 aa  93.2  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  21.15 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  29.32 
 
 		 466 aa  92  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  21.91 
 
 		 444 aa  89.7  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  25.5 
 
 		 476 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  29.84 
 
 		 465 aa  89.4  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  22.56 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01977  FeS assembly protein SufD  24.4 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  29.84 
 
 		 465 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  29.84 
 
 		 465 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  25.37 
 
 		 477 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  26.76 
 
 		 440 aa  87.8  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  24 
 
 		 476 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1661  FeS assembly protein SufD  26.22 
 
 		 419 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.249285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  23.67 
 
 		 445 aa  87  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  33.97 
 
 		 471 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  28.97 
 
 		 438 aa  86.7  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  23.76 
 
 		 426 aa  86.7  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  27.75 
 
 		 499 aa  86.3  8e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  22.09 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  26.7 
 
 		 487 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12900  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  34.04 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  25.65 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  24.88 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  25.5 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1136  FeS assembly protein SufD  24.88 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0309349 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  22.47 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  33.33 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  25.47 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2384  FeS assembly protein SufD  23.11 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  24.77 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  25.68 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  27.23 
 
 		 552 aa  84.3  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  26.47 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2443  FeS assembly protein SufD  23.85 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.83747  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0987  SufBD protein  22.33 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137837  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2272  SufBD protein  27.32 
 
 		 481 aa  83.6  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11489  hypothetical protein  24.08 
 
 		 846 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000249036  normal  0.700584 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  24.5 
 
 		 476 aa  83.2  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  23.62 
 
 		 441 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  28.27 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2264  FeS assembly protein SufD  22.3 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  25.13 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3082  FeS assembly protein SufD  23.88 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0565637  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14630  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  24.3 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>