240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1207 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1207  SufBD protein  100 
 
 		 364 aa  714    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.124978  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0892  FeS assembly protein SufD  23.44 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1113  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  26.51 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185623  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1907  FeS assembly protein SufD  21.13 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1839  SufBD protein  23.3 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  25.63 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  28.3 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0132  SufBD protein  23.53 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2253  FeS assembly protein SufD  27.23 
 
 		 425 aa  62.8  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0219  hypothetical protein  23.81 
 
 		 420 aa  62.8  0.000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  22.46 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0709  FeS assembly protein SufD  24.75 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  26.05 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  26.05 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  25.58 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  26.05 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  26.05 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  25.58 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  25.58 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0927  FeS assembly protein SufD  26.24 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0496  FeS assembly protein SufD  32.82 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0933  hypothetical protein  26.24 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478935  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  25.58 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  25.58 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1656  SufBD protein  24.65 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  25.58 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0605  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  26.59 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0238111  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0125  hypothetical protein  23.37 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0190029  hitchhiker  0.00579103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2443  FeS assembly protein SufD  26.39 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.83747  normal  0.102174 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  24.26 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0384  FeS assembly protein SufD  27.88 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  33.64 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2962  FeS assembly protein SufD  26.6 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0049  SufBD protein  35.24 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  32.73 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  28.38 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  34 
 
 		 435 aa  57  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0581  FeS assembly protein SufD  31.25 
 
 		 434 aa  57  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.19168  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1169  SufBD protein  21.97 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.038096  normal  0.786569 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0085  hypothetical protein  23.28 
 
 		 381 aa  57  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  24.8 
 
 		 468 aa  57  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2437  FeS assembly protein SufD  26.26 
 
 		 396 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2482  FeS assembly protein SufD  26.26 
 
 		 396 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16140  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  26.25 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  23.94 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  31.13 
 
 		 425 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  24.53 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2473  FeS assembly protein SufD  26.26 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  24.53 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0987  SufBD protein  24.32 
 
 		 423 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137837  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0198  SufBD  31.79 
 
 		 244 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  28.12 
 
 		 446 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  32 
 
 		 435 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  32 
 
 		 435 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  26.11 
 
 		 437 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  26.34 
 
 		 467 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  23.64 
 
 		 404 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  27.07 
 
 		 464 aa  53.5  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.32 
 
 		 470 aa  53.1  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14630  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  25.76 
 
 		 440 aa  53.1  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  26.32 
 
 		 464 aa  53.1  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  27.03 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  29.27 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.03 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 		 430 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1141  FeS assembly protein SufD  28.57 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.303866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  28.1 
 
 		 467 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  27.03 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1466  FeS assembly protein SufD  25.39 
 
 		 425 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269271  normal  0.0505489 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.03 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  34.78 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  32.06 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2037  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  26.47 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2591  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.3 
 
 		 441 aa  51.6  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  30.56 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1850  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.3 
 
 		 441 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0513191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11490  hypothetical protein  24.91 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106141  normal  0.412126 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.05 
 
 		 423 aa  50.8  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.05 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  0.00000429728 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.05 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  24.01 
 
 		 444 aa  50.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  27.03 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  22.09 
 
 		 434 aa  50.4  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  29.01 
 
 		 474 aa  50.4  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2508  FeS assembly protein SufD  25.54 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.62478  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5153  FeS assembly protein SufD  24.07 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  25.56 
 
 		 471 aa  50.8  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.49 
 
 		 423 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  35.44 
 
 		 440 aa  50.4  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.49 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  24.69 
 
 		 422 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2551  FeS assembly protein SufD  37.1 
 
 		 401 aa  50.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1358  FeS assembly protein SufD  28.22 
 
 		 398 aa  50.1  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.49 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.49 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000806248 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.49 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.49 
 
 		 423 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  0.0000000349756 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0812  FeS assembly protein SufD  21.23 
 
 		 421 aa  50.1  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0156327  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  28.41 
 
 		 430 aa  50.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0998  FeS assembly protein SufD  27.56 
 
 		 420 aa  49.7  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364227  normal  0.129171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>