More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1850 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1744  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  96.37 
 
 		 441 aa  845    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000189062  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1850  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  100 
 
 		 441 aa  917    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0513191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2591  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  99.77 
 
 		 441 aa  914    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  66.36 
 
 		 430 aa  572  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  63.93 
 
 		 448 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  63.47 
 
 		 448 aa  560  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  56.98 
 
 		 423 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  59.55 
 
 		 430 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  58.35 
 
 		 423 aa  488  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  56.29 
 
 		 423 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  0.0000000349756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  56.52 
 
 		 423 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206713 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  56.29 
 
 		 423 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000806248 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  56.52 
 
 		 423 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  58.35 
 
 		 423 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  56.06 
 
 		 423 aa  487  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  0.0000315224 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  58.35 
 
 		 423 aa  486  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  58.35 
 
 		 423 aa  485  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  58.35 
 
 		 423 aa  485  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  58.35 
 
 		 423 aa  485  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  58.35 
 
 		 423 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  0.00000429728 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  57.89 
 
 		 423 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  58.12 
 
 		 423 aa  484  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0463  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  48.51 
 
 		 432 aa  385  1e-106  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.366005  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  35.17 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0581  FeS assembly protein SufD  35.33 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.19168  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  36.59 
 
 		 446 aa  234  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  35.31 
 
 		 426 aa  232  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  35.06 
 
 		 447 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  35.31 
 
 		 426 aa  232  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  32.24 
 
 		 445 aa  231  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  33.16 
 
 		 451 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  0.0000000788125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  32.84 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  32.08 
 
 		 425 aa  213  7e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  33 
 
 		 439 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  32.82 
 
 		 454 aa  209  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  34 
 
 		 434 aa  209  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  31.6 
 
 		 441 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000908978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  32.7 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  33.42 
 
 		 439 aa  202  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  34.91 
 
 		 442 aa  199  7.999999999999999e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  33.25 
 
 		 454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  31.39 
 
 		 438 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0798  FeS assembly protein SufD  31.73 
 
 		 448 aa  198  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  33.95 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  31.99 
 
 		 453 aa  196  8.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  29.9 
 
 		 428 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  33.59 
 
 		 433 aa  195  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  29.26 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  34.18 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  29.88 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  33.33 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  33.08 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0417  FeS assembly protein SufD  29.54 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0428  FeS assembly protein SufD  29.54 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  32.83 
 
 		 437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  32.41 
 
 		 439 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  32.83 
 
 		 437 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  32.28 
 
 		 475 aa  189  9e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  33.68 
 
 		 430 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4731  FeS assembly protein SufD  29.25 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  29.55 
 
 		 436 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0998  FeS assembly protein SufD  34.34 
 
 		 420 aa  187  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364227  normal  0.129171 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  30.85 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  29.48 
 
 		 459 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  32.92 
 
 		 439 aa  186  9e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01977  FeS assembly protein SufD  33.95 
 
 		 420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  30.36 
 
 		 440 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  28.86 
 
 		 444 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1346  FeS assembly protein SufD  32.52 
 
 		 419 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.641587  hitchhiker  0.00000000191252 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  31.92 
 
 		 437 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  29.81 
 
 		 426 aa  176  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  30.65 
 
 		 437 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  29.85 
 
 		 437 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  32.97 
 
 		 422 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  30.12 
 
 		 437 aa  173  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  30 
 
 		 444 aa  172  9e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.993052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  30.6 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  32.67 
 
 		 445 aa  170  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  28.39 
 
 		 440 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  32.16 
 
 		 422 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  31.52 
 
 		 441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  30.31 
 
 		 424 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0242  hypothetical protein  28.54 
 
 		 439 aa  160  4e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01359  Cysteine desulfurase activator SufB  29.08 
 
 		 418 aa  159  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.043139  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1466  FeS assembly protein SufD  31.66 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269271  normal  0.0505489 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  28.28 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  30 
 
 		 467 aa  156  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  27.91 
 
 		 422 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  29.97 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  28.47 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0781  FeS assembly protein SufD  28.27 
 
 		 444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  28.65 
 
 		 439 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5107  FeS assembly protein SufD  30.31 
 
 		 439 aa  146  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1606  FeS assembly protein SufD  29.3 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0238755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  30.83 
 
 		 446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2359  SufBD protein  29.79 
 
 		 427 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.421889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0168  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  27.49 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  27.7 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2358  SufBD  28.47 
 
 		 430 aa  137  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0697  SufBD protein  27.36 
 
 		 440 aa  136  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0893866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>