More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1502 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  100 
 
 		 408 aa  839    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  95.45 
 
 		 396 aa  786    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  94.85 
 
 		 408 aa  804    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  81.62 
 
 		 408 aa  716    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  67.41 
 
 		 406 aa  585  1e-166  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  47.21 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  47.46 
 
 		 407 aa  373  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  44.74 
 
 		 416 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  47.53 
 
 		 390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  44.08 
 
 		 407 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  43.84 
 
 		 408 aa  343  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  43.86 
 
 		 403 aa  341  2e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  45.19 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  44.47 
 
 		 411 aa  334  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  44.73 
 
 		 411 aa  333  2e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  43.81 
 
 		 411 aa  332  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  43.67 
 
 		 393 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  41.95 
 
 		 388 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  45.18 
 
 		 370 aa  318  1e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  42.74 
 
 		 384 aa  316  4e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  42.44 
 
 		 386 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  45.4 
 
 		 371 aa  309  4e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  44.83 
 
 		 394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  42.9 
 
 		 369 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  43.24 
 
 		 388 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  44.72 
 
 		 369 aa  295  7e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  39.31 
 
 		 387 aa  293  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  38.98 
 
 		 368 aa  272  7e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  34.62 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  35.35 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  34.69 
 
 		 398 aa  234  3e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  33.57 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  30.41 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  31.92 
 
 		 469 aa  186  7e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  28.67 
 
 		 470 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  31.25 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  27.78 
 
 		 469 aa  176  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  28.84 
 
 		 471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  29.06 
 
 		 488 aa  173  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  29.87 
 
 		 464 aa  173  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  29.78 
 
 		 465 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  29.43 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  29.61 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  27.05 
 
 		 468 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  29.3 
 
 		 465 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  29.3 
 
 		 465 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  28.35 
 
 		 476 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  26.67 
 
 		 467 aa  166  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  29.08 
 
 		 472 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  28.61 
 
 		 476 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  28.65 
 
 		 467 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  29.08 
 
 		 472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  29.35 
 
 		 470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.76 
 
 		 470 aa  163  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  28.92 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  28.92 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  28.92 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  28.92 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  28.99 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  28.92 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  28.92 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  28.67 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  28.92 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  28.92 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  27.1 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  28.31 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  28.29 
 
 		 469 aa  160  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  28.97 
 
 		 472 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  27.3 
 
 		 470 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  26 
 
 		 472 aa  160  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  27.97 
 
 		 479 aa  160  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  27.03 
 
 		 470 aa  159  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  29.74 
 
 		 473 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  28.76 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  27.7 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  27.3 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  27.75 
 
 		 481 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  27.3 
 
 		 472 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  29.44 
 
 		 465 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  29.19 
 
 		 465 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  26.74 
 
 		 475 aa  156  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  27.95 
 
 		 465 aa  156  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  27.21 
 
 		 470 aa  156  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  30 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  28.21 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  27.49 
 
 		 481 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  27.37 
 
 		 476 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  26.25 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  28.61 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  27.27 
 
 		 479 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.56 
 
 		 483 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  27.72 
 
 		 485 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.97 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  27.45 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  28.5 
 
 		 479 aa  154  4e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  26.77 
 
 		 485 aa  153  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  26.42 
 
 		 476 aa  154  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  26.72 
 
 		 487 aa  153  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.52 
 
 		 469 aa  153  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.01 
 
 		 482 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>