255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04792 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04792  short chain dehydrogenase  100 
 
 
110 aa  226  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132046  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.69 
 
 
245 aa  135  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.58 
 
 
250 aa  98.6  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.08 
 
 
248 aa  83.6  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  50 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  43.43 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.83 
 
 
252 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 
244 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 
245 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.94 
 
 
263 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230027  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.36 
 
 
246 aa  71.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 
244 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.58 
 
 
242 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
250 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0227742 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.97 
 
 
244 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
250 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  decreased coverage  0.000126478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.61 
 
 
229 aa  60.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
227 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
272 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.57 
 
 
240 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.89 
 
 
233 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.3 
 
 
239 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
245 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
247 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5116  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.22 
 
 
238 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
265 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  44.44 
 
 
240 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 
251 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02039  short chain oxidoreductase (CsgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00910)  31.82 
 
 
251 aa  54.7  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.049775  normal  0.21203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.07 
 
 
237 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.67 
 
 
229 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
241 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 
241 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.66 
 
 
248 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
233 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.604748  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
249 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.85 
 
 
237 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0676  short chain dehydrogenase  42.47 
 
 
231 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931099  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.79 
 
 
239 aa  48.9  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.21 
 
 
264 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.33 
 
 
228 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5711  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
246 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02369  short chain dehydrogenase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15350)  36.08 
 
 
309 aa  46.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.406317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.76 
 
 
263 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.02 
 
 
223 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
227 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
274 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  40.98 
 
 
248 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.94 
 
 
246 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.0656338 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.94 
 
 
246 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509467  normal  0.742025 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.94 
 
 
246 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.16 
 
 
245 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455308  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.5 
 
 
223 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.85459  normal  0.0309227 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.76 
 
 
246 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.94 
 
 
246 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.94 
 
 
246 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
235 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.76 
 
 
247 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 
257 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.19 
 
 
231 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.94 
 
 
246 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.54 
 
 
246 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
250 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0185509  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  38.3 
 
 
244 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6948  putative short chain oxidoreductase  57.5 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 
270 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  51.22 
 
 
252 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  51.22 
 
 
252 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
231 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4571  short chain dehydrogenase  32.29 
 
 
228 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000728936  hitchhiker  0.00656486 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01860  Short chain dehydrogenase family protein  43.14 
 
 
219 aa  44.3  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  48.78 
 
 
252 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  48.78 
 
 
252 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  48.78 
 
 
252 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  48.78 
 
 
252 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  48.78 
 
 
252 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
236 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
236 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
250 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  48.78 
 
 
252 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  48.78 
 
 
252 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.22 
 
 
254 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.260797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
284 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  37.66 
 
 
247 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.38 
 
 
246 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.289767  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3419  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.38 
 
 
246 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.184809  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.38 
 
 
246 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0158219  normal  0.051875 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 
238 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.69 
 
 
214 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
252 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  52.5 
 
 
257 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
312 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0637  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
228 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000253756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2405  acetoin dehydrogenase  41.38 
 
 
260 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  52.5 
 
 
254 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3129  short chain dehydrogenase  47.62 
 
 
226 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  52.5 
 
 
254 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>