More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02601 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02601  transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3322  transcriptional regulator, AraC family  64.55 
 
 		 299 aa  394  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0422488  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  30.08 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1619  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.28 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  33.07 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  37.38 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 314 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1138  helix-turn-helix domain-containing protein  35.05 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  36.26 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  36.26 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  28.33 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1108  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.26 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110935  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  36.26 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  31.75 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  29.58 
 
 		 393 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  29.2 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  38.14 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  31.68 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  30.83 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3021  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 361 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.826436 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  26.72 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.05 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  25.64 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1683  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0213  transcriptional regulator, AraC family protein  19.2 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887507 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  28.03 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  30.69 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5109  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0905505  normal  0.0237076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4679  transcriptional regulator, AraC family  34.58 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603206  hitchhiker  0.000201737 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  22.88 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  31.5 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  25.69 
 
 		 513 aa  58.9  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4910  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.45379  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 148 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  34.41 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9084  transcriptional regulator AraC family  31.52 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  22.32 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0125  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>