More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00195 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00195  glycosyltransferase  100 
 
 
399 aa  795    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.799849  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
388 aa  64.7  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.64 
 
 
388 aa  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1477  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
380 aa  63.2  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0885553  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  35.9 
 
 
450 aa  63.2  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1533  GumH protein  26.33 
 
 
380 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0821  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.53 
 
 
401 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0720659  normal  0.0739715 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
415 aa  61.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.29 
 
 
388 aa  61.6  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.29 
 
 
365 aa  60.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
370 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 
407 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
419 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
362 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.19 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2101  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.82 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445016  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  32.68 
 
 
417 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.49 
 
 
375 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
366 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  22.91 
 
 
397 aa  57  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  32.35 
 
 
427 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
366 aa  56.6  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_002950  PG1141  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.52 
 
 
397 aa  56.6  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  29.38 
 
 
377 aa  56.6  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4118  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
392 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7628  Glycosyltransferase-like protein  30.89 
 
 
372 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294474  normal  0.180766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
367 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
393 aa  56.2  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1460  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32 
 
 
374 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114403  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  28.24 
 
 
443 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
756 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  32 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  27.65 
 
 
452 aa  56.2  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0804  group 1 glycosyl transferase  29.17 
 
 
425 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817981  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1775  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.41 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3696  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
350 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  23.13 
 
 
507 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
366 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
448 aa  54.3  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  32.53 
 
 
480 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  31.54 
 
 
430 aa  54.3  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.49 
 
 
376 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.95 
 
 
375 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0132  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
359 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00903136  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 
386 aa  53.5  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  30.28 
 
 
413 aa  53.1  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.56 
 
 
431 aa  53.1  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.35 
 
 
378 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  28 
 
 
383 aa  52.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1996  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0691436 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49124  predicted protein  40.3 
 
 
444 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469563  normal  0.18765 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  28.49 
 
 
466 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
423 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2548  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.339834  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01398  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumH  22.91 
 
 
380 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  34.19 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.28 
 
 
404 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0384  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
392 aa  52.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6015  GumH protein  25.59 
 
 
397 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  42.11 
 
 
382 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
376 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
744 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  22.58 
 
 
369 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
404 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
409 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1496  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
339 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1247  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
391 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174724  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
371 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14970  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.06 
 
 
381 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1433  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
375 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.259311  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
461 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  30.43 
 
 
378 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
412 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0780  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
369 aa  50.8  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.716964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2170  glycosyl transferase, group 1  47.06 
 
 
366 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0477227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
440 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0276  glycosyl transferase group 1  20.38 
 
 
342 aa  50.4  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.949437  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2468  putative glycosyltransferase  28.86 
 
 
448 aa  50.4  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
1241 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0518  putative glycosyltransferase protein  47.06 
 
 
366 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
395 aa  50.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
407 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
382 aa  50.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1364  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.08 
 
 
388 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
426 aa  50.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 
967 aa  50.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  33.11 
 
 
401 aa  50.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
401 aa  50.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
418 aa  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
421 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  28.97 
 
 
375 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>