More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3162 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3162  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0308091  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3028  hypothetical protein  95.73 
 
 		 234 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.154556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3677  hypothetical protein  77.78 
 
 		 234 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3178  hypothetical protein  76.07 
 
 		 233 aa  362  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.235776 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18190  hypothetical protein  76.39 
 
 		 232 aa  357  9e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0382  hypothetical protein  71.31 
 
 		 237 aa  341  5.999999999999999e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2376  hypothetical protein  69.62 
 
 		 237 aa  337  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3561  hypothetical protein  69.2 
 
 		 237 aa  330  9e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3165  hypothetical protein  70.64 
 
 		 237 aa  328  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2550  hypothetical protein  70.64 
 
 		 237 aa  328  6e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  decreased coverage  0.00627186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3366  hypothetical protein  70.64 
 
 		 237 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699657  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2221  hypothetical protein  71.06 
 
 		 236 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2928  hypothetical protein  67.09 
 
 		 237 aa  321  5e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1700  hypothetical protein  65.96 
 
 		 234 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3517  hypothetical protein  62.55 
 
 		 233 aa  287  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000201859  normal  0.326196 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  42.62 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  43.93 
 
 		 247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3172  hypothetical protein  45.45 
 
 		 243 aa  169  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  42.98 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  43.51 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  44.21 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  41.77 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  42.19 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  42.98 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  42.19 
 
 		 247 aa  162  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  42.49 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  42.42 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  41.7 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  43.04 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  42.06 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  40 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  40.09 
 
 		 240 aa  159  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  41.28 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  41.28 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  43.1 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  43.22 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  43.22 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  39.22 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  40.51 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  40.09 
 
 		 248 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  40.09 
 
 		 248 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  40.09 
 
 		 248 aa  155  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  40.6 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  40.51 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  40.51 
 
 		 248 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  40.51 
 
 		 248 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  43.1 
 
 		 248 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  41.28 
 
 		 250 aa  154  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  40.34 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  39.15 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2522  hypothetical protein  39.63 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  40.09 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  38.49 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  39.08 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  39.66 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  40.09 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  42.06 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  38.17 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  39.41 
 
 		 246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  39.66 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  39.92 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  41.53 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  40.6 
 
 		 250 aa  152  5e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  41.7 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  41.45 
 
 		 250 aa  151  7e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  43.1 
 
 		 248 aa  151  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  36.48 
 
 		 241 aa  151  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1461  hypothetical protein  39.24 
 
 		 240 aa  151  8e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  40.34 
 
 		 248 aa  151  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  38.08 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0624  hypothetical protein  39.58 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  37.93 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  39.22 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  40.6 
 
 		 253 aa  149  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  38.56 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  39.66 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  39.83 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0661  hypothetical protein  40.09 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  40.09 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0528  protein of unknown function DUF28  37.77 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  41.95 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  39.22 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  39.22 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2018  protein of unknown function DUF28  40.77 
 
 		 245 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.687235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  37.71 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  39.22 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  39.22 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  39.08 
 
 		 250 aa  148  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  42.44 
 
 		 248 aa  148  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  38.79 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  36.71 
 
 		 250 aa  148  8e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  38.66 
 
 		 250 aa  148  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  40.34 
 
 		 248 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  41.1 
 
 		 249 aa  148  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0709  protein of unknown function DUF28  39.83 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  38.96 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  38.79 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  39.22 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  36.44 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>