More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_18190 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_18190  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3178  hypothetical protein  86.21 
 
 
233 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.235776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3028  hypothetical protein  78.11 
 
 
234 aa  359  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.154556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3677  hypothetical protein  76.39 
 
 
234 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3162  hypothetical protein  76.39 
 
 
234 aa  343  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0308091  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2376  hypothetical protein  71.91 
 
 
237 aa  342  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0382  hypothetical protein  72.46 
 
 
237 aa  342  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2221  hypothetical protein  73.19 
 
 
236 aa  340  8e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3561  hypothetical protein  70.76 
 
 
237 aa  340  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200071  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2550  hypothetical protein  73.31 
 
 
237 aa  337  7e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  decreased coverage  0.00627186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3165  hypothetical protein  73.31 
 
 
237 aa  337  7e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3366  hypothetical protein  73.31 
 
 
237 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699657  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2928  hypothetical protein  69.07 
 
 
237 aa  328  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1700  hypothetical protein  69.36 
 
 
234 aa  325  4.0000000000000003e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3517  hypothetical protein  66.24 
 
 
233 aa  312  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000201859  normal  0.326196 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  44.54 
 
 
252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3172  hypothetical protein  46.03 
 
 
243 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  44.54 
 
 
247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  45.37 
 
 
248 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  44.49 
 
 
247 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  45.12 
 
 
248 aa  169  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  44.8 
 
 
248 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  44.95 
 
 
252 aa  167  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  45.13 
 
 
247 aa  166  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  43.4 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  43.4 
 
 
247 aa  165  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  41.44 
 
 
246 aa  165  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  43.86 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  42.8 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  43.46 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2522  hypothetical protein  43.78 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  43.69 
 
 
250 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  43.69 
 
 
250 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  42.37 
 
 
247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  44.8 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  41.77 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  44.09 
 
 
243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  42.24 
 
 
249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  40.83 
 
 
243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  43.42 
 
 
253 aa  162  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0450  hypothetical protein  47.21 
 
 
251 aa  162  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  44 
 
 
253 aa  161  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0839  DNA-binding regulatory protein, YebC/PmpR family  45.73 
 
 
252 aa  160  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  45.12 
 
 
248 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  44.19 
 
 
248 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  44.59 
 
 
248 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  42.92 
 
 
240 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  44.59 
 
 
248 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  43.46 
 
 
246 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  42.53 
 
 
248 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  46.85 
 
 
248 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  41.35 
 
 
246 aa  158  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  40.95 
 
 
248 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2317  hypothetical protein  42.59 
 
 
242 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.693566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  40.95 
 
 
248 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1682  hypothetical protein  42.59 
 
 
242 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.074172  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  42.86 
 
 
241 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2294  hypothetical protein  42.59 
 
 
242 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  41.1 
 
 
250 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  45.25 
 
 
248 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  45.25 
 
 
248 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  43.89 
 
 
248 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5621  hypothetical protein  42.59 
 
 
242 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577981  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2210  hypothetical protein  42.59 
 
 
242 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.495132  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  44.34 
 
 
248 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  40.95 
 
 
248 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  40.95 
 
 
248 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1015  hypothetical protein  41.67 
 
 
242 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0624  hypothetical protein  43.58 
 
 
244 aa  155  4e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2332  hypothetical protein  42.59 
 
 
242 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.933086  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0984  hypothetical protein  42.59 
 
 
242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2190  hypothetical protein  41.94 
 
 
241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  40.74 
 
 
239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1953  hypothetical protein  40.47 
 
 
241 aa  155  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1231  hypothetical protein  41.82 
 
 
242 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1884  hypothetical protein  41.82 
 
 
242 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  42.99 
 
 
248 aa  155  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1385  hypothetical protein  41.82 
 
 
242 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.823747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  43.44 
 
 
248 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1240  hypothetical protein  41.82 
 
 
242 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0366087  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1988  hypothetical protein  43.06 
 
 
241 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2388  hypothetical protein  43.06 
 
 
241 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1075  hypothetical protein  41.82 
 
 
242 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0358  hypothetical protein  41.82 
 
 
242 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0792  hypothetical protein  41.82 
 
 
242 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166344  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  44.59 
 
 
245 aa  154  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  40.17 
 
 
250 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  44.7 
 
 
246 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  39.66 
 
 
248 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  39.66 
 
 
248 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1461  hypothetical protein  40.09 
 
 
240 aa  154  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  39.66 
 
 
248 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  44.65 
 
 
246 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  40.52 
 
 
248 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1301  hypothetical protein  41.63 
 
 
242 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17975  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  40.91 
 
 
250 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  42.53 
 
 
248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3259  hypothetical protein  41.63 
 
 
242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  39.91 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  39.66 
 
 
248 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>