More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3677 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3677  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3178  hypothetical protein  77.78 
 
 		 233 aa  370  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.235776 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3028  hypothetical protein  78.63 
 
 		 234 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.154556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0382  hypothetical protein  73.42 
 
 		 237 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3366  hypothetical protein  77.02 
 
 		 237 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699657  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3162  hypothetical protein  77.78 
 
 		 234 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0308091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18190  hypothetical protein  76.39 
 
 		 232 aa  355  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2550  hypothetical protein  76.6 
 
 		 237 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  decreased coverage  0.00627186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3165  hypothetical protein  76.6 
 
 		 237 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2221  hypothetical protein  77.02 
 
 		 236 aa  348  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3561  hypothetical protein  71.73 
 
 		 237 aa  348  5e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2376  hypothetical protein  68.35 
 
 		 237 aa  337  8e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2928  hypothetical protein  68.35 
 
 		 237 aa  332  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1700  hypothetical protein  67.66 
 
 		 234 aa  318  5e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3517  hypothetical protein  63.83 
 
 		 233 aa  298  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000201859  normal  0.326196 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  43.1 
 
 		 248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0624  hypothetical protein  42.08 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  39.66 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3172  hypothetical protein  43.8 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  43.91 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  40.95 
 
 		 240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  41.13 
 
 		 250 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  40.52 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  41.53 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  41.03 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  41.95 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2522  hypothetical protein  41.67 
 
 		 241 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  42.98 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2190  hypothetical protein  40.74 
 
 		 241 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  40.6 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  39.66 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  42.55 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  37.71 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  40.69 
 
 		 247 aa  155  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  42.49 
 
 		 252 aa  154  9e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  39.83 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  41.63 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  39.15 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  41.1 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  41.42 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  39.83 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  37.82 
 
 		 246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1988  hypothetical protein  40.28 
 
 		 241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2388  hypothetical protein  40.28 
 
 		 241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  39.83 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  38.24 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0785  hypothetical protein  40.28 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356846  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  36.91 
 
 		 241 aa  152  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  38.4 
 
 		 250 aa  151  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2237  hypothetical protein  46.32 
 
 		 249 aa  151  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  39.41 
 
 		 250 aa  150  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  38.63 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  40.09 
 
 		 250 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  40.09 
 
 		 250 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0661  hypothetical protein  40.69 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135239  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  41.95 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  40.43 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  40 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  38.98 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  42.13 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  41.95 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  40.52 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3259  hypothetical protein  38.64 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  39.66 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  40.87 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  39.48 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  40.43 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1682  hypothetical protein  40.28 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.074172  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  37.76 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2294  hypothetical protein  40.28 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2317  hypothetical protein  40.28 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.693566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  38.98 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5621  hypothetical protein  40.28 
 
 		 242 aa  148  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  38.63 
 
 		 248 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  38.63 
 
 		 248 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  38.63 
 
 		 248 aa  148  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  40.77 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  37.6 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  39.41 
 
 		 248 aa  148  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  38.2 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  39.57 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4067  hypothetical protein  37.93 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.751245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  40 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  37.45 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0984  hypothetical protein  39.35 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  38.2 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  38.79 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  38.79 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2210  hypothetical protein  39.81 
 
 		 242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.495132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  38.63 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  38.2 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  38.2 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1015  hypothetical protein  38.89 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  36.64 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  39.15 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  37.5 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  37.5 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0528  protein of unknown function DUF28  38.56 
 
 		 246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  39.91 
 
 		 248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>