279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_55091 on replicon NC_011692
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011692  PHATRDRAFT_55091  predicted protein  100 
 
 		 524 aa  1084    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0343  cryptochrome, DASH family  28.13 
 
 		 488 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4538  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.71 
 
 		 498 aa  193  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0700  cryptochrome, DASH family  27.86 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2235  cryptochrome, DASH family  30.11 
 
 		 483 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.14399  normal  0.570848 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0729  cryptochrome, DASH family  27.29 
 
 		 488 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264496  normal  0.107921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6186  cryptochrome, DASH family  27.02 
 
 		 487 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1053  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.77 
 
 		 434 aa  166  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2595  cryptochrome, DASH family  27.38 
 
 		 478 aa  154  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0775599  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07806  probable bacterial cryptochrome  24.28 
 
 		 421 aa  134  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1411  cryptochrome, DASH family  40 
 
 		 447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1548  DNA photolyase FAD-binding subunit  25.1 
 
 		 448 aa  123  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1410  RNA-binding cryptochrome Cry1  38.17 
 
 		 461 aa  123  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0320  DNA photolyase FAD-binding subunit  34.74 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0336  cryptochrome DASH  36.76 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3718  cryptochrome, DASH family  23.11 
 
 		 430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3953  cryptochrome, DASH family  39.2 
 
 		 515 aa  114  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06693  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.78 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000796  deoxyribodipyrimidine photolyase single-strand-specific  34.59 
 
 		 444 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0152  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.17 
 
 		 445 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  34.77 
 
 		 468 aa  110  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1491  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.7 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.675954 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29275  predicted protein  35.68 
 
 		 551 aa  109  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1364  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.38 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.24 
 
 		 484 aa  107  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.41 
 
 		 479 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1212  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.05 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.0350184 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34592  cry-dash from the cryptochrome/photolyase family  24.38 
 
 		 610 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1613  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.95 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03651  putative DNA photolyase  23.26 
 
 		 504 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0263  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.96 
 
 		 490 aa  104  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4676  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.15 
 
 		 500 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499221 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0811  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.32 
 
 		 475 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  36.54 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4337  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.52 
 
 		 396 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1383  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.89 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0135788  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0994  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.51 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  36.54 
 
 		 471 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25 
 
 		 487 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0780  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.18 
 
 		 475 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2745  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.36 
 
 		 513 aa  100  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0241  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.33 
 
 		 492 aa  100  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00387  DNA photolyase (Eurofung)  28.62 
 
 		 567 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.892479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1302  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.62 
 
 		 456 aa  99.4  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.674491  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.57 
 
 		 486 aa  99.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0733  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.09 
 
 		 472 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3694  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.22 
 
 		 484 aa  99.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5903  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.96 
 
 		 436 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.696635 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00668  deoxyribodipyrimidine photolyase, FAD-binding  35.09 
 
 		 473 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0625  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.09 
 
 		 472 aa  98.6  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0080  deoxyribodipyrimidine photolyase, cyclobutane pyrimidine dimer-specific  33.92 
 
 		 469 aa  99.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000198558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00657  hypothetical protein  35.09 
 
 		 456 aa  99  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2947  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.09 
 
 		 472 aa  99  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139043  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2928  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.65 
 
 		 472 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1380  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.36 
 
 		 470 aa  98.2  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866986  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1921  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.31 
 
 		 488 aa  98.6  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1562  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.5 
 
 		 471 aa  98.2  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.51951  normal  0.490223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2838  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.89 
 
 		 497 aa  98.2  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.182548  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0755  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.65 
 
 		 472 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.391934  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3068  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.51 
 
 		 500 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2879  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.89 
 
 		 470 aa  97.8  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1958  deoxyribodipyrimidine photolyase (photoreactivating enzyme)  36.02 
 
 		 433 aa  97.8  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021636 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1134  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.43 
 
 		 477 aa  97.8  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172014  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4618  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.05 
 
 		 515 aa  97.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0723  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.92 
 
 		 472 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.867142 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0798  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.65 
 
 		 472 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1113  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  32.85 
 
 		 474 aa  97.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.289495  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2541  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.05 
 
 		 466 aa  97.4  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.272644 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0591  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.26 
 
 		 481 aa  97.1  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.2693 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1165  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.03 
 
 		 493 aa  97.4  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1236  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.03 
 
 		 493 aa  97.1  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1309  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.16 
 
 		 499 aa  97.1  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3054  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.51 
 
 		 505 aa  96.7  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.746759  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1801  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.29 
 
 		 488 aa  97.1  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4086  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.2 
 
 		 449 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2217  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.34 
 
 		 525 aa  96.7  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511177  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0739  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.94 
 
 		 480 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4450  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.18 
 
 		 480 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0817  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.56 
 
 		 473 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.32 
 
 		 445 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1166  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.85 
 
 		 493 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2084  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.32 
 
 		 445 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0767  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.13 
 
 		 475 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2021  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.32 
 
 		 445 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.128536 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0439  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  32.6 
 
 		 435 aa  95.1  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0831  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.06 
 
 		 473 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.31293  hitchhiker  0.0019608 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4333  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.66 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.652268 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2087  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.96 
 
 		 434 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0527605  normal  0.0533895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0029  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.78 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.919202  normal  0.63493 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05122  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.12 
 
 		 471 aa  95.9  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.05 
 
 		 463 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11303  deoxyribodipyrimidine photolyase-class I  33.15 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2903  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.07 
 
 		 478 aa  95.1  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5899  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.31 
 
 		 519 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0769953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2178  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.31 
 
 		 519 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.74 
 
 		 492 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0866  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.06 
 
 		 473 aa  94.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001252  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.98 
 
 		 471 aa  94.7  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553687  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3211  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.16 
 
 		 499 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.26 
 
 		 476 aa  94.4  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>