More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12305 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_12305  predicted protein  100 
 
 		 303 aa  627  1e-178  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45850  silent information regulator protein Sir2  50.68 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16859  predicted protein  37.79 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07461  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05900)  37.58 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.12277 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16771  predicted protein  35.74 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0241463 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04320  NAD-dependent histone deacetylase, putative  34.18 
 
 		 413 aa  145  9e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00681381  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08450  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00520)  34.55 
 
 		 2081 aa  139  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.601211 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40594  NAD-dependent histone deacetylase SIR2 (Regulatory protein SIR2) (Silent information regulator 2)  33.45 
 
 		 391 aa  139  6e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.326026 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10449  histone deacetylase (Eurofung)  31.55 
 
 		 489 aa  123  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.882233 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32025  putative histone deacetylase-like protein  34.31 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.822239  normal  0.176883 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_2658  NAD-dependent histone deacetylase  30.17 
 
 		 425 aa  118  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.755641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8827  predicted protein  33.05 
 
 		 219 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  29.37 
 
 		 241 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2843  NAD-dependent deacetylase  29.74 
 
 		 245 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  29 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0631  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  29.72 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  29.37 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  29.37 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  29 
 
 		 241 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  29.18 
 
 		 242 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  29 
 
 		 245 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02940  histone deacetylase, putative  27.67 
 
 		 596 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  29 
 
 		 245 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  31.93 
 
 		 237 aa  99.4  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  32.68 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  29.96 
 
 		 242 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  30.15 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  27.74 
 
 		 252 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01226  SIR2 family histone deacetylase (Hst4), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10540)  27.36 
 
 		 595 aa  97.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.184046 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  28.42 
 
 		 246 aa  98.2  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  29.66 
 
 		 253 aa  96.7  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1781  NAD-dependent deacetylase  30.15 
 
 		 250 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  28.74 
 
 		 241 aa  96.3  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  29.11 
 
 		 250 aa  95.9  7e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0957  silent information regulator protein Sir2  29.07 
 
 		 253 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.925274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  28.08 
 
 		 242 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  30.33 
 
 		 244 aa  91.3  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  28.73 
 
 		 231 aa  90.5  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 251 aa  89.4  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49645  NAD-dependent deacetylase HST3 (Homologous to SIR2 protein 3)  28.44 
 
 		 342 aa  89.4  7e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838214  normal  0.585457 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  27.95 
 
 		 245 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  28.15 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  26.96 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  27.64 
 
 		 256 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  30.4 
 
 		 257 aa  85.9  7e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  29.51 
 
 		 249 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  29.51 
 
 		 243 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  29.87 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  30.4 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  28.85 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  29.51 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  29.2 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  29.46 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  28.12 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  28.57 
 
 		 254 aa  82  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  27.87 
 
 		 234 aa  82  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  28.38 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  28.35 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2267  NAD-dependent deacetylase  27.34 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  27.87 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2228  NAD-dependent deacetylase  27.34 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8513  Silent information regulator protein Sir2  26.72 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  30.61 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  26.37 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  28.86 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21543  predicted protein  27.71 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  28.14 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  28.29 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  28.29 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0866  Silent information regulator protein Sir2  28.12 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0208  NAD-dependent deacetylase  27.13 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  27.35 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  30.8 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  28.4 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  26.95 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0295  Silent information regulator protein Sir2  25.87 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.216345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  28.4 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  24.25 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  29.32 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  28.98 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  27.56 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  26.89 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  27.78 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  29.32 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  30.5 
 
 		 252 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  26.69 
 
 		 266 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  30.17 
 
 		 251 aa  75.5  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  29.72 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  27.49 
 
 		 259 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  27.76 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1797  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  27.09 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  29.92 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  27.71 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0501  NAD-dependent deacetylase  27.92 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  27.16 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  27.8 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  24.11 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  27.8 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  28.57 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>