More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_8827 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_8827  predicted protein  100 
 
 
219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10449  histone deacetylase (Eurofung)  41.83 
 
 
489 aa  169  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.882233 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07461  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05900)  41.51 
 
 
361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.12277 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04320  NAD-dependent histone deacetylase, putative  44.17 
 
 
413 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00681381  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_2658  NAD-dependent histone deacetylase  40 
 
 
425 aa  145  7.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.755641  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02940  histone deacetylase, putative  34.62 
 
 
596 aa  142  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40594  NAD-dependent histone deacetylase SIR2 (Regulatory protein SIR2) (Silent information regulator 2)  37.96 
 
 
391 aa  138  7.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.326026 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08450  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00520)  40.4 
 
 
2081 aa  137  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.601211 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32025  putative histone deacetylase-like protein  37.26 
 
 
326 aa  135  6.0000000000000005e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.822239  normal  0.176883 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16859  predicted protein  36.73 
 
 
264 aa  132  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16771  predicted protein  40.31 
 
 
329 aa  128  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0241463 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  35.75 
 
 
256 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  37.38 
 
 
246 aa  124  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  41.06 
 
 
234 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  36.54 
 
 
250 aa  123  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  37.38 
 
 
248 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  35.58 
 
 
244 aa  121  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  35.58 
 
 
244 aa  121  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  38.76 
 
 
243 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  35.05 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  36.19 
 
 
253 aa  115  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  34.62 
 
 
252 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  36.5 
 
 
256 aa  115  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  32.85 
 
 
249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  36 
 
 
251 aa  112  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  34.76 
 
 
245 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  34.78 
 
 
256 aa  111  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  35.57 
 
 
252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0631  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  34.11 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  36.19 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  36.54 
 
 
237 aa  108  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12305  predicted protein  33.05 
 
 
303 aa  108  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  33.18 
 
 
256 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  34.58 
 
 
254 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0957  silent information regulator protein Sir2  35.44 
 
 
253 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.925274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  36.67 
 
 
242 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  36.67 
 
 
245 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  36.67 
 
 
245 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  33.49 
 
 
251 aa  105  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1781  NAD-dependent deacetylase  36.71 
 
 
250 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  36.67 
 
 
245 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  36.19 
 
 
242 aa  105  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  34.69 
 
 
231 aa  105  7e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  34.95 
 
 
262 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  36.19 
 
 
242 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  36.15 
 
 
241 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  33.02 
 
 
257 aa  103  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  35.71 
 
 
241 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  31.53 
 
 
242 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  36.1 
 
 
248 aa  102  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  30.39 
 
 
242 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  36.19 
 
 
242 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  34.47 
 
 
256 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  35.71 
 
 
241 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  36.23 
 
 
238 aa  102  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2843  NAD-dependent deacetylase  36.19 
 
 
245 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  35.86 
 
 
248 aa  102  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  32.84 
 
 
249 aa  101  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  34.78 
 
 
261 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  35.64 
 
 
243 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  34.45 
 
 
247 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  34.45 
 
 
244 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  32.55 
 
 
242 aa  99.8  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  32.39 
 
 
251 aa  99  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  33.17 
 
 
245 aa  99  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  34.43 
 
 
254 aa  99  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  31.07 
 
 
252 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45850  silent information regulator protein Sir2  32.46 
 
 
328 aa  98.2  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  34.12 
 
 
244 aa  98.6  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  31.84 
 
 
247 aa  98.2  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  34.1 
 
 
244 aa  98.2  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  30.62 
 
 
248 aa  98.2  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  33.01 
 
 
263 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2228  NAD-dependent deacetylase  31.4 
 
 
243 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2267  NAD-dependent deacetylase  31.4 
 
 
243 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  35.07 
 
 
260 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2468  Silent information regulator protein Sir2  31.25 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  32.5 
 
 
236 aa  96.3  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  31.98 
 
 
245 aa  96.7  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  32.44 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  31.43 
 
 
262 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  32.7 
 
 
246 aa  95.9  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  36.04 
 
 
251 aa  95.9  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  31.1 
 
 
259 aa  94  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0208  NAD-dependent deacetylase  32.85 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  31.88 
 
 
259 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  33 
 
 
251 aa  94  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  32.37 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1553  silent information regulator protein Sir2  30.1 
 
 
253 aa  92.8  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.469137  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  32.21 
 
 
267 aa  93.2  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1797  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  32.37 
 
 
233 aa  93.2  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0091  NAD-dependent deacetylase  31.03 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0206655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  32.2 
 
 
249 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  30.63 
 
 
256 aa  92.4  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0295  Silent information regulator protein Sir2  31.2 
 
 
283 aa  92  6e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.216345 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  33.02 
 
 
245 aa  92  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  30.29 
 
 
251 aa  92  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2183  NAD-dependent deacetylase  28.63 
 
 
345 aa  91.7  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622873  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  29.3 
 
 
233 aa  91.7  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  31.73 
 
 
248 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>