298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_49645 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_49645  NAD-dependent deacetylase HST3 (Homologous to SIR2 protein 3)  100 
 
 		 342 aa  709    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838214  normal  0.585457 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03250  hst3 protein, putative  38.32 
 
 		 389 aa  239  5e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01226  SIR2 family histone deacetylase (Hst4), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10540)  35.53 
 
 		 595 aa  183  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.184046 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04500  hst4 protein, putative  32.21 
 
 		 478 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.268314  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10449  histone deacetylase (Eurofung)  31.19 
 
 		 489 aa  126  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.882233 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02940  histone deacetylase, putative  29.51 
 
 		 596 aa  126  6e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40594  NAD-dependent histone deacetylase SIR2 (Regulatory protein SIR2) (Silent information regulator 2)  31.21 
 
 		 391 aa  122  7e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.326026 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_2658  NAD-dependent histone deacetylase  30.1 
 
 		 425 aa  121  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.755641  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07461  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05900)  31.97 
 
 		 361 aa  116  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.12277 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16771  predicted protein  32.82 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0241463 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2843  NAD-dependent deacetylase  29.14 
 
 		 245 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  27.71 
 
 		 242 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  28.15 
 
 		 245 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  27.83 
 
 		 242 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  28.15 
 
 		 245 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  28.15 
 
 		 245 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  25.57 
 
 		 247 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  29.29 
 
 		 246 aa  94  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  27.81 
 
 		 241 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  27.01 
 
 		 241 aa  92.4  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16859  predicted protein  29.46 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  26.75 
 
 		 242 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  27.6 
 
 		 256 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32025  putative histone deacetylase-like protein  29.61 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.822239  normal  0.176883 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  27.65 
 
 		 244 aa  91.3  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  27.65 
 
 		 244 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8827  predicted protein  31.01 
 
 		 219 aa  90.5  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  27.39 
 
 		 242 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12305  predicted protein  28.44 
 
 		 303 aa  89.4  9e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04320  NAD-dependent histone deacetylase, putative  30.77 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00681381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  29.21 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  27.02 
 
 		 253 aa  87  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  28.28 
 
 		 238 aa  87  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 251 aa  85.9  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  25.83 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08450  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00520)  25.45 
 
 		 2081 aa  84.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.601211 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  30.18 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  24.91 
 
 		 234 aa  85.1  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  26.01 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  29.92 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  25.95 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1781  NAD-dependent deacetylase  28.08 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0631  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  28.19 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  25.83 
 
 		 254 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  24 
 
 		 263 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  30.34 
 
 		 243 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  26.82 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  26.87 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  27.61 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  28.94 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0091  NAD-dependent deacetylase  28.94 
 
 		 237 aa  79  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0206655 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  25.51 
 
 		 231 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  24.91 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2267  NAD-dependent deacetylase  29.08 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2228  NAD-dependent deacetylase  29.08 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  26.26 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  25.37 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  26.21 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  24.19 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  25.28 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  26.91 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0957  silent information regulator protein Sir2  28.52 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.925274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  26.91 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  25.63 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  26.14 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  25 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1962  Silent information regulator protein Sir2  25.18 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000762796  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45850  silent information regulator protein Sir2  25.23 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  27.56 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  26.09 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  27.82 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18630  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  23.91 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0409224  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  27.24 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  26.69 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  27.17 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  26.97 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  27.21 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  27.41 
 
 		 245 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  25.42 
 
 		 256 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  27.8 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  25.46 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  26.42 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4181  NAD-dependent deacetylase  25.42 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000834887  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0208  NAD-dependent deacetylase  26.92 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3550  silent information regulator protein Sir2  22.26 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  29.12 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3545  silent information regulator protein Sir2  22.26 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3618  silent information regulator protein Sir2  22.26 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.688367  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  26 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  25.11 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17240  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  25 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0983545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  23.32 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0528  Silent information regulator protein Sir2  23.3 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.02282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  25.91 
 
 		 269 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  26.04 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  26.92 
 
 		 251 aa  68.9  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  26.99 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  23.88 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  26.42 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  25.48 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>