140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0925 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  100 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  58.97 
 
 		 197 aa  249  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  64.67 
 
 		 214 aa  246  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  63.39 
 
 		 193 aa  240  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  62.98 
 
 		 194 aa  235  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  63.43 
 
 		 190 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  58.25 
 
 		 213 aa  225  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  58.29 
 
 		 201 aa  214  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  56.82 
 
 		 209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  51.41 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  51.11 
 
 		 198 aa  187  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  51.98 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  50 
 
 		 198 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  50.55 
 
 		 194 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  50 
 
 		 194 aa  178  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  50 
 
 		 195 aa  178  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  50 
 
 		 195 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  50 
 
 		 194 aa  178  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  50 
 
 		 195 aa  178  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  50 
 
 		 195 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  50 
 
 		 194 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  50 
 
 		 195 aa  177  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  49.45 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  48.09 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  50.28 
 
 		 195 aa  175  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  44.67 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  44.67 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  43.65 
 
 		 199 aa  171  9e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  47.28 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  48.13 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  46.93 
 
 		 358 aa  166  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  47.03 
 
 		 229 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  48.9 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  42.37 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  40.91 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  43.96 
 
 		 193 aa  154  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  46.15 
 
 		 202 aa  154  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  45.86 
 
 		 357 aa  153  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  47.62 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  41.4 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  40.4 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  39.66 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  42.08 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  42.11 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  44.75 
 
 		 178 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  37.63 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  44.81 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  38.89 
 
 		 179 aa  131  7.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  38.2 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  37.14 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  39.08 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  37.14 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  40.22 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  39.66 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  34.97 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  32.63 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  38.54 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14315  predicted protein  28.8 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1364  thymidine kinase  27.51 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  27.62 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  26.97 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1971  thymidine kinase  28.42 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  27.47 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  26.63 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  30 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1249  thymidine kinase  25 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2162  thymidine kinase  26.98 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2858  thymidine kinase  26.86 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0118174  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  29.38 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2468  thymidine kinase  26.78 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0799997  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2178  thymidine kinase  26.78 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000221215  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0016  thymidine kinase  24.87 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5292  thymidine kinase  28.65 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0626  thymidine kinase  28.33 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02120  thymidine kinase  28 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0451  thymidine kinase  25.57 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0410  thymidine kinase  25.56 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0792  thymidine kinase  27.37 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.318927  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2641  thymidine kinase  34.86 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.414214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1449  thymidine kinase  26.67 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000965494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0626  thymidine kinase  33.94 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1574  thymidine kinase  26.21 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.630387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2487  thymidine kinase  35.35 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3814  thymidine kinase  25.28 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111719  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0856  thymidine kinase  24.86 
 
 		 163 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000143946  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2198  thymidine kinase  28.19 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  25.56 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  25 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1410  thymidine kinase  25 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1173  thymidine kinase  26.86 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0685  thymidine kinase  25.14 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.136148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2506  thymidine kinase  26.11 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  26.82 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3324  thymidine kinase  32.69 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4385  thymidine kinase  25.53 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  25.97 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1357  thymidine kinase  24.44 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.694875  normal  0.123525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1422  thymidine kinase  24.44 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1982  thymidine kinase  28.19 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2705  thymidine kinase  25.56 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000762715  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>