149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1726 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  100 
 
 		 199 aa  410  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  86.43 
 
 		 199 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  86.43 
 
 		 199 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  65.82 
 
 		 205 aa  275  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  66.14 
 
 		 194 aa  269  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  64.29 
 
 		 195 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  64.29 
 
 		 195 aa  268  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  64.29 
 
 		 195 aa  268  4e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  64.29 
 
 		 195 aa  268  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  64.29 
 
 		 195 aa  268  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  65.61 
 
 		 194 aa  267  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  65.61 
 
 		 194 aa  267  7e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  65.61 
 
 		 194 aa  267  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  65.08 
 
 		 194 aa  267  8.999999999999999e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  63.78 
 
 		 195 aa  267  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  63.64 
 
 		 207 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  60.96 
 
 		 193 aa  240  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  59.09 
 
 		 198 aa  238  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  56.32 
 
 		 200 aa  236  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  58.29 
 
 		 203 aa  236  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  57.73 
 
 		 357 aa  235  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  54.64 
 
 		 219 aa  226  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  56.02 
 
 		 198 aa  224  9e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  58.79 
 
 		 202 aa  221  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  54.08 
 
 		 229 aa  220  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  51.04 
 
 		 209 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  55.98 
 
 		 358 aa  210  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  49.21 
 
 		 202 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  51.41 
 
 		 213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  51.85 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  48.94 
 
 		 203 aa  191  6e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  48.09 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  50.84 
 
 		 209 aa  184  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  47.4 
 
 		 197 aa  184  8e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  49.73 
 
 		 214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  47.28 
 
 		 193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  48.13 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  48.37 
 
 		 193 aa  176  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  45.26 
 
 		 194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  47.03 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  45.11 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  43.65 
 
 		 204 aa  171  7.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  49.15 
 
 		 190 aa  170  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  45.25 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  46.74 
 
 		 193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  41.57 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  40 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  43.65 
 
 		 196 aa  138  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  37.57 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  36.36 
 
 		 201 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  35.42 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  41.01 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  37.64 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  37.08 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  38.38 
 
 		 179 aa  115  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  32.42 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  33.33 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  30.51 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  30.51 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  30.51 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  28.89 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1173  thymidine kinase  29.83 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2861  thymidine kinase  29.38 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1357  thymidine kinase  29.44 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.694875  normal  0.123525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1422  thymidine kinase  29.44 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1971  thymidine kinase  29.61 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  27.93 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  30.9 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  27.78 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  30.26 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  26.42 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1410  thymidine kinase  28.89 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2506  thymidine kinase  30.81 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1449  thymidine kinase  32.02 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000965494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02627  thymidine kinase  30.77 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152525  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  30 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2887  thymidine kinase  29.83 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000233672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0451  thymidine kinase  26.4 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0685  thymidine kinase  30 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.136148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2851  thymidine kinase  32.42 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  28.65 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  28.11 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2305  thymidine kinase  30.17 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.494936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2389  thymidine kinase  30.73 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.375716  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2198  thymidine kinase  27.66 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0410  thymidine kinase  31.05 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1941  thymidine kinase  28.09 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  28.73 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01214  thymidine kinase  30.17 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01224  hypothetical protein  30.17 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1347  thymidine kinase  30.17 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00949382  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1724  thymidine kinase  30.17 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.433864  normal  0.600941 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1387  thymidine kinase  30.17 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1902  thymidine kinase  30.17 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.354275  normal  0.231836 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2411  Thymidine kinase  30.17 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00467829  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5292  thymidine kinase  30 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2745  thymidine kinase  28.65 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2579  thymidine kinase  29.78 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1403  thymidine kinase  30.17 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63011  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1578  thymidine kinase  29.57 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0557569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>