148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2155 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  100 
 
 
199 aa  413  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  100 
 
 
199 aa  413  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  86.43 
 
 
199 aa  365  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  64.65 
 
 
205 aa  265  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  62.96 
 
 
207 aa  257  8e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  62.76 
 
 
195 aa  254  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  62.24 
 
 
195 aa  254  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  62.24 
 
 
195 aa  254  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  62.24 
 
 
195 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  62.24 
 
 
195 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  62.24 
 
 
195 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  63.49 
 
 
194 aa  252  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  63.49 
 
 
194 aa  252  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  63.49 
 
 
194 aa  252  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  63.49 
 
 
194 aa  252  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  62.96 
 
 
194 aa  251  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  62.03 
 
 
193 aa  237  6.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  58.08 
 
 
198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  57.53 
 
 
203 aa  233  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  57.53 
 
 
200 aa  231  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  57.58 
 
 
357 aa  231  5e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  57.07 
 
 
198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  52.58 
 
 
219 aa  218  3.9999999999999997e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  56.32 
 
 
202 aa  218  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  53.12 
 
 
229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  51.55 
 
 
358 aa  210  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  49.75 
 
 
209 aa  203  2e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  50.26 
 
 
202 aa  199  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  53.67 
 
 
213 aa  197  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  53.72 
 
 
194 aa  193  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  47.87 
 
 
203 aa  187  1e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  51.37 
 
 
214 aa  185  5e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  48.63 
 
 
201 aa  184  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  52.51 
 
 
197 aa  184  8e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  49.16 
 
 
209 aa  181  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  47.87 
 
 
194 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  48.37 
 
 
193 aa  176  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  46.32 
 
 
193 aa  175  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  45.99 
 
 
223 aa  174  7e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  44.67 
 
 
204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  47.78 
 
 
184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  47.49 
 
 
185 aa  171  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  48.11 
 
 
186 aa  167  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  48.91 
 
 
193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  47.46 
 
 
190 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  38.69 
 
 
194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  40.33 
 
 
191 aa  138  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  40.45 
 
 
196 aa  137  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  44.2 
 
 
196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  38.98 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  37.5 
 
 
201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  41.9 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  38.2 
 
 
184 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  37.64 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  39.46 
 
 
179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  33.52 
 
 
196 aa  107  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  35 
 
 
195 aa  106  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  29.44 
 
 
212 aa  79  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  28.96 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  30.21 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02627  thymidine kinase  31.32 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152525  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  25.91 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  29.44 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2506  thymidine kinase  29.89 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2887  thymidine kinase  30.85 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000233672  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  29.44 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  29.44 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1971  thymidine kinase  32.6 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  30.94 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  29.83 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  28.42 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0685  thymidine kinase  31.87 
 
 
192 aa  72  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.136148  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0410  thymidine kinase  29.83 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1173  thymidine kinase  29.83 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  29.78 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1410  thymidine kinase  28.33 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68463  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  28.89 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1357  thymidine kinase  28.33 
 
 
192 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.694875  normal  0.123525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1422  thymidine kinase  28.33 
 
 
192 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0451  thymidine kinase  28.02 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2198  thymidine kinase  30.11 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  27.62 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2861  thymidine kinase  28.33 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1982  thymidine kinase  29.32 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2851  thymidine kinase  30.81 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2305  thymidine kinase  29.12 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.494936  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1249  thymidine kinase  25.79 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01214  thymidine kinase  29.12 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01224  hypothetical protein  29.12 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1347  thymidine kinase  29.12 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00949382  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1724  thymidine kinase  29.12 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.433864  normal  0.600941 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1387  thymidine kinase  29.12 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2389  thymidine kinase  29.12 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.375716  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1902  thymidine kinase  29.12 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.354275  normal  0.231836 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2411  Thymidine kinase  29.12 
 
 
205 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00467829  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2283  thymidine kinase  29.32 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5292  thymidine kinase  31.67 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1877  thymidine kinase  30.77 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1940  thymidine kinase  30.77 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0864548  normal  0.836147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1395  thymidine kinase  30.77 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.252717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>