113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0856 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0856  thymidine kinase  100 
 
 
163 aa  332  1e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000143946  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  29.34 
 
 
205 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  24.73 
 
 
194 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  24.73 
 
 
195 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  24.73 
 
 
195 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  24.73 
 
 
194 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  24.73 
 
 
195 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  24.73 
 
 
195 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  24.73 
 
 
194 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  24.73 
 
 
195 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  26.17 
 
 
185 aa  58.9  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  24.19 
 
 
194 aa  57.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  27.33 
 
 
184 aa  57.8  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  26.58 
 
 
195 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  29.61 
 
 
207 aa  57.4  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  27.59 
 
 
199 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  26.67 
 
 
194 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  31.79 
 
 
358 aa  55.1  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  26.71 
 
 
223 aa  55.5  0.0000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  24.73 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  24.31 
 
 
195 aa  52.4  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  25.71 
 
 
196 aa  52.4  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  26.06 
 
 
199 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  26.06 
 
 
199 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  23.23 
 
 
209 aa  50.8  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  24.86 
 
 
204 aa  50.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  25.97 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  20.86 
 
 
202 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  25.97 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  25 
 
 
219 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  27.01 
 
 
187 aa  48.9  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01843  thymidine kinase  27.62 
 
 
182 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  25.81 
 
 
192 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  23.87 
 
 
209 aa  48.5  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  24.71 
 
 
193 aa  48.5  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2487  thymidine kinase  26.47 
 
 
192 aa  48.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003836  thymidine kinase  28.57 
 
 
192 aa  48.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0878421  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0451  thymidine kinase  28.16 
 
 
191 aa  47.8  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0685  thymidine kinase  24.84 
 
 
192 aa  47.4  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.136148  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  22 
 
 
196 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2745  thymidine kinase  29.11 
 
 
192 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0736  thymidine kinase  29.52 
 
 
192 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00541015  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  21.43 
 
 
200 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  24.43 
 
 
213 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  24.58 
 
 
189 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1249  thymidine kinase  24.53 
 
 
199 aa  45.8  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  24.52 
 
 
192 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2506  thymidine kinase  29.11 
 
 
192 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  24.52 
 
 
192 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02627  thymidine kinase  27.85 
 
 
193 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152525  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  28.08 
 
 
201 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  26.74 
 
 
190 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  29.63 
 
 
192 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2705  thymidine kinase  27.62 
 
 
194 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000762715  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2283  thymidine kinase  24.53 
 
 
201 aa  44.7  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  23.6 
 
 
189 aa  44.7  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2887  thymidine kinase  25.27 
 
 
192 aa  44.7  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000233672  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  23.58 
 
 
198 aa  44.7  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1982  thymidine kinase  24.53 
 
 
198 aa  44.7  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4385  thymidine kinase  26.42 
 
 
197 aa  44.3  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1410  thymidine kinase  29.63 
 
 
192 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68463  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  25.83 
 
 
191 aa  44.3  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  27.85 
 
 
192 aa  44.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  24.84 
 
 
192 aa  44.3  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2178  thymidine kinase  27.61 
 
 
199 aa  44.3  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000221215  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1357  thymidine kinase  29.63 
 
 
192 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.694875  normal  0.123525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1422  thymidine kinase  29.63 
 
 
192 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1877  thymidine kinase  26.98 
 
 
205 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1940  thymidine kinase  26.98 
 
 
205 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0864548  normal  0.836147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1883  thymidine kinase  26.98 
 
 
205 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.290604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1395  thymidine kinase  26.98 
 
 
205 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.252717  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1578  thymidine kinase  26.98 
 
 
205 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0557569  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2861  thymidine kinase  28.26 
 
 
192 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2468  thymidine kinase  27.61 
 
 
199 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0799997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1449  thymidine kinase  29.11 
 
 
192 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000965494  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  23.16 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1941  thymidine kinase  29.52 
 
 
192 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  26.67 
 
 
209 aa  42.7  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  22.16 
 
 
357 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0070  Thymidine kinase  25.71 
 
 
198 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00429283  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2198  thymidine kinase  22.64 
 
 
199 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  26.43 
 
 
214 aa  42.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  23.26 
 
 
211 aa  42.4  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1173  thymidine kinase  29.49 
 
 
192 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2579  thymidine kinase  29.11 
 
 
192 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0410  thymidine kinase  27.62 
 
 
195 aa  42  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0792  thymidine kinase  22.52 
 
 
196 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.318927  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1964  thymidine kinase  22.65 
 
 
196 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2166  thymidine kinase  22.65 
 
 
196 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.856509  normal  0.128361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2073  thymidine kinase  22.65 
 
 
196 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329931  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2822  thymidine kinase  26.92 
 
 
200 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0513947 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  22.92 
 
 
198 aa  42  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2851  thymidine kinase  27.85 
 
 
192 aa  41.6  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  23.12 
 
 
203 aa  41.2  0.006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3324  thymidine kinase  23.81 
 
 
204 aa  41.2  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  25.71 
 
 
194 aa  41.2  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2162  thymidine kinase  27.16 
 
 
196 aa  40.8  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0016  thymidine kinase  27.16 
 
 
196 aa  40.8  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3091  thymidine kinase  26.92 
 
 
200 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0626  thymidine kinase  25.71 
 
 
200 aa  40.8  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>