147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22350 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  100 
 
 		 191 aa  375  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  58.38 
 
 		 196 aa  193  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  43.17 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  44.2 
 
 		 207 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  44.74 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  45.25 
 
 		 200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  43.33 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  40.33 
 
 		 199 aa  138  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  40.33 
 
 		 199 aa  138  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  36.41 
 
 		 358 aa  137  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  48.62 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  40.88 
 
 		 193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  42.22 
 
 		 209 aa  134  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  41.99 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  42.46 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  43.02 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  41.57 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  44.13 
 
 		 202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  43.58 
 
 		 213 aa  130  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  36.51 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  41.34 
 
 		 198 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  41.11 
 
 		 201 aa  128  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  37.97 
 
 		 357 aa  127  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  42.13 
 
 		 195 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  37.57 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  41.57 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  41.57 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  41.57 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  41.57 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  41.57 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  41.57 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  41.57 
 
 		 194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  41.57 
 
 		 195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  40.45 
 
 		 194 aa  124  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  39.27 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  36.81 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  41.57 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  37.3 
 
 		 190 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  43.71 
 
 		 214 aa  118  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  36.96 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  42.08 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  42.22 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  35.91 
 
 		 187 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  34.78 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  37.78 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  38.33 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  35.71 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  34.97 
 
 		 204 aa  110  9e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  32.8 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  32.98 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  37.02 
 
 		 178 aa  109  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  32.07 
 
 		 201 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  42.08 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  39.36 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  40.11 
 
 		 193 aa  100  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  33.33 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  37.7 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02627  thymidine kinase  30.05 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152525  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0626  thymidine kinase  30 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1877  thymidine kinase  29.95 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1940  thymidine kinase  29.95 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0864548  normal  0.836147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1883  thymidine kinase  29.95 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.290604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1395  thymidine kinase  29.95 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.252717  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1578  thymidine kinase  29.95 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0557569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2305  thymidine kinase  29.95 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.494936  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2411  Thymidine kinase  29.95 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00467829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1724  thymidine kinase  29.95 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.433864  normal  0.600941 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1387  thymidine kinase  29.95 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2389  thymidine kinase  29.95 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.375716  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1902  thymidine kinase  29.95 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.354275  normal  0.231836 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01214  thymidine kinase  29.41 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01224  hypothetical protein  29.41 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1347  thymidine kinase  29.41 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00949382  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  28.88 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  28.88 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2162  thymidine kinase  28.95 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  28.88 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2283  thymidine kinase  31.18 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  29.1 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1964  thymidine kinase  29.69 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2166  thymidine kinase  29.69 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.856509  normal  0.128361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2073  thymidine kinase  29.69 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329931  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2745  thymidine kinase  29.47 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0016  thymidine kinase  28.42 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1403  thymidine kinase  29.41 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63011  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1971  thymidine kinase  28.57 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0626  thymidine kinase  30.69 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1982  thymidine kinase  30.65 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2861  thymidine kinase  28.34 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  27.89 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2579  thymidine kinase  27.81 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2705  thymidine kinase  29.17 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000762715  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  27.81 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0410  thymidine kinase  27.89 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1449  thymidine kinase  27.81 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000965494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2851  thymidine kinase  27.27 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  27.03 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  27.27 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3814  thymidine kinase  29.17 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111719  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2887  thymidine kinase  27.51 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000233672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>