152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0410 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0410  thymidine kinase  100 
 
 		 195 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0736  thymidine kinase  69.47 
 
 		 192 aa  286  9e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00541015  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003836  thymidine kinase  68.42 
 
 		 192 aa  285  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0878421  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2389  thymidine kinase  68.42 
 
 		 205 aa  283  9e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.375716  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1941  thymidine kinase  67.89 
 
 		 192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1877  thymidine kinase  67.89 
 
 		 205 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1940  thymidine kinase  67.89 
 
 		 205 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0864548  normal  0.836147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1883  thymidine kinase  67.89 
 
 		 205 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.290604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1395  thymidine kinase  67.89 
 
 		 205 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.252717  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1578  thymidine kinase  67.89 
 
 		 205 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0557569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1724  thymidine kinase  67.89 
 
 		 205 aa  282  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.433864  normal  0.600941 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1387  thymidine kinase  67.89 
 
 		 205 aa  282  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85808  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02627  thymidine kinase  67.54 
 
 		 193 aa  282  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01214  thymidine kinase  67.89 
 
 		 205 aa  281  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2411  Thymidine kinase  67.89 
 
 		 205 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00467829  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01224  hypothetical protein  67.89 
 
 		 205 aa  281  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1347  thymidine kinase  67.89 
 
 		 205 aa  281  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00949382  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1902  thymidine kinase  67.89 
 
 		 205 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.354275  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  68.59 
 
 		 192 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1964  thymidine kinase  67.88 
 
 		 196 aa  280  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5651  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1449  thymidine kinase  67.02 
 
 		 192 aa  280  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000965494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2166  thymidine kinase  67.88 
 
 		 196 aa  280  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.856509  normal  0.128361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2073  thymidine kinase  67.88 
 
 		 196 aa  280  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329931  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1173  thymidine kinase  66.49 
 
 		 192 aa  279  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1403  thymidine kinase  67.37 
 
 		 205 aa  279  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63011  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2305  thymidine kinase  67.37 
 
 		 204 aa  278  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.494936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2579  thymidine kinase  67.02 
 
 		 192 aa  278  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2705  thymidine kinase  68.95 
 
 		 194 aa  278  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000762715  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  65.45 
 
 		 192 aa  275  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2745  thymidine kinase  65.97 
 
 		 192 aa  274  6e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1357  thymidine kinase  66.49 
 
 		 192 aa  274  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.694875  normal  0.123525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1422  thymidine kinase  66.49 
 
 		 192 aa  274  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  65.97 
 
 		 192 aa  273  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  65.97 
 
 		 192 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  65.97 
 
 		 192 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1410  thymidine kinase  65.97 
 
 		 192 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2861  thymidine kinase  65.97 
 
 		 192 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  64.92 
 
 		 192 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2851  thymidine kinase  65.45 
 
 		 192 aa  270  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  67.38 
 
 		 198 aa  270  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2198  thymidine kinase  68.09 
 
 		 199 aa  269  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01843  thymidine kinase  68.33 
 
 		 182 aa  269  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2506  thymidine kinase  65.62 
 
 		 192 aa  267  8e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2887  thymidine kinase  65.96 
 
 		 192 aa  266  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000233672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1982  thymidine kinase  66.84 
 
 		 198 aa  264  7e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2283  thymidine kinase  66.84 
 
 		 201 aa  263  8e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0685  thymidine kinase  64.25 
 
 		 192 aa  258  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.136148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03622  thymidine kinase  59.9 
 
 		 209 aa  250  8.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3814  thymidine kinase  60.64 
 
 		 199 aa  250  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111719  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0626  thymidine kinase  62.83 
 
 		 194 aa  248  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0047  thymidine kinase  58.95 
 
 		 206 aa  248  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  0.139333 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1971  thymidine kinase  59.16 
 
 		 192 aa  248  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  60.64 
 
 		 209 aa  245  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  60.11 
 
 		 209 aa  244  6e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2641  thymidine kinase  55.32 
 
 		 199 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.414214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2162  thymidine kinase  59.04 
 
 		 196 aa  242  3e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2487  thymidine kinase  57.37 
 
 		 192 aa  241  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0016  thymidine kinase  58.51 
 
 		 196 aa  240  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3324  thymidine kinase  55.26 
 
 		 204 aa  239  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0538  thymidine kinase  58.51 
 
 		 197 aa  239  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.113985  normal  0.408144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0626  thymidine kinase  54.74 
 
 		 200 aa  236  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1744  thymidine kinase  56.84 
 
 		 192 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622959  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3277  thymidine kinase  50 
 
 		 192 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2822  thymidine kinase  53.4 
 
 		 200 aa  222  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0513947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3091  thymidine kinase  52.88 
 
 		 200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0792  thymidine kinase  54.01 
 
 		 196 aa  204  7e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.318927  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0451  thymidine kinase  50.8 
 
 		 191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  51.87 
 
 		 189 aa  197  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  51.34 
 
 		 189 aa  194  9e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2037  thymidine kinase  50.26 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.92367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0070  Thymidine kinase  48.15 
 
 		 198 aa  190  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00429283  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1249  thymidine kinase  48.19 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  48.94 
 
 		 212 aa  177  8e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4385  thymidine kinase  45.16 
 
 		 197 aa  171  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  45.99 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2858  thymidine kinase  43.92 
 
 		 186 aa  158  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0118174  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15850  thymidine kinase  41.18 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.153347  normal  0.0942863 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1574  thymidine kinase  43.3 
 
 		 209 aa  148  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.630387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12890  thymidine kinase  43.3 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2468  thymidine kinase  43.16 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0799997  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2178  thymidine kinase  43.16 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000221215  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02120  thymidine kinase  40.98 
 
 		 213 aa  141  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0149  Thymidine kinase  42.02 
 
 		 183 aa  140  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1697  Thymidine kinase  36.92 
 
 		 221 aa  133  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0421472  normal  0.248537 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17490  thymidine kinase  39.04 
 
 		 202 aa  133  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110309  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5292  thymidine kinase  43.85 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1625  thymidine kinase  33.5 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000168316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2907  Thymidine kinase  39.38 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4250  thymidine kinase  40.26 
 
 		 236 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266037  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1929  Thymidine kinase  35.64 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.142712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0234  thymidine kinase  40.65 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3408  thymidine kinase  34.36 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1631  thymidine kinase  32.2 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0686564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6597  Thymidine kinase  34.21 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2707  Thymidine kinase  33 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154523  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2919  thymidine kinase  33.17 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21760  thymidine kinase  36.05 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.613703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1932  thymidine kinase  36.77 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23777  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2930  thymidine kinase  35.32 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00129909  hitchhiker  0.0000388394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2486  thymidine kinase  30.5 
 
 		 234 aa  98.2  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.472803 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>