154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2828 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  100 
 
 		 202 aa  406  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  57.3 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  56.84 
 
 		 198 aa  214  5e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  58.38 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  56.22 
 
 		 194 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  56.22 
 
 		 195 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  56.22 
 
 		 195 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  56.22 
 
 		 195 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  56.22 
 
 		 195 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  56.22 
 
 		 194 aa  211  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  56.22 
 
 		 194 aa  211  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  56.22 
 
 		 194 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  56.22 
 
 		 195 aa  210  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  54.21 
 
 		 193 aa  207  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  56.83 
 
 		 198 aa  207  8e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  57.38 
 
 		 202 aa  207  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  55.68 
 
 		 195 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  54.05 
 
 		 194 aa  202  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  50.26 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  50.26 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  49.21 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  54.59 
 
 		 229 aa  191  8e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  53.01 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  46.63 
 
 		 358 aa  185  4e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  51.09 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  46.52 
 
 		 203 aa  174  6e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  46.32 
 
 		 209 aa  174  7e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  47.64 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  47.85 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  50.54 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  50 
 
 		 193 aa  165  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  46.81 
 
 		 357 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  47.45 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  51.09 
 
 		 193 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  43.01 
 
 		 186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  46.2 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  47.54 
 
 		 184 aa  158  6e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  42.49 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  46.74 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  45.5 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  46.15 
 
 		 204 aa  154  8e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  45.65 
 
 		 209 aa  153  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  45.2 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  44.13 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  51.67 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  43.33 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  48.62 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  40.33 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  36.51 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  40.44 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  39.89 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  37.57 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  38.3 
 
 		 178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  34.62 
 
 		 196 aa  115  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  34.59 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  32.09 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  34.78 
 
 		 179 aa  99.4  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  32.61 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  29.55 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  32.43 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  27.78 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  28.33 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5292  thymidine kinase  32.22 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  28.89 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4385  thymidine kinase  31.84 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1449  thymidine kinase  29.67 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000965494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  29.83 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  29.89 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0792  thymidine kinase  27.07 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.318927  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0685  thymidine kinase  29.89 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.136148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  29.83 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  29.83 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3324  thymidine kinase  30.32 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1249  thymidine kinase  28.02 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2745  thymidine kinase  29.89 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2487  thymidine kinase  29.83 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2851  thymidine kinase  29.35 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  30.77 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0626  thymidine kinase  29.51 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02627  thymidine kinase  26.78 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152525  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17490  thymidine kinase  32.07 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110309  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3814  thymidine kinase  31.55 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111719  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2861  thymidine kinase  28.73 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1964  thymidine kinase  27.87 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2166  thymidine kinase  27.87 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.856509  normal  0.128361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2073  thymidine kinase  27.87 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2579  thymidine kinase  29.89 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2506  thymidine kinase  27.87 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2705  thymidine kinase  28.96 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000762715  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  28.04 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  28.42 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0070  Thymidine kinase  30 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00429283  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1971  thymidine kinase  29.03 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0626  thymidine kinase  27.43 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2283  thymidine kinase  28.04 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0451  thymidine kinase  24.14 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1982  thymidine kinase  28.04 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1357  thymidine kinase  27.07 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.694875  normal  0.123525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1422  thymidine kinase  27.07 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1410  thymidine kinase  27.07 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>