134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf165 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  100 
 
 
194 aa  401  1e-111  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  45.64 
 
 
194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  44.1 
 
 
194 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  43.59 
 
 
194 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  43.59 
 
 
194 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  45.21 
 
 
195 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  43.59 
 
 
194 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  44.68 
 
 
195 aa  158  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  44.68 
 
 
195 aa  158  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  44.68 
 
 
195 aa  158  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  44.68 
 
 
195 aa  157  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  40.91 
 
 
204 aa  157  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  43.62 
 
 
193 aa  155  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  45.11 
 
 
193 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  44.28 
 
 
198 aa  154  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  44.15 
 
 
195 aa  154  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  43.39 
 
 
209 aa  153  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  43.46 
 
 
198 aa  153  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  47.19 
 
 
190 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  43.01 
 
 
201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  42.49 
 
 
205 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  44.77 
 
 
197 aa  148  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  44.02 
 
 
202 aa  148  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  42.16 
 
 
214 aa  145  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  40 
 
 
207 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  40.98 
 
 
194 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  41.58 
 
 
229 aa  142  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  40.21 
 
 
223 aa  142  4e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  44.63 
 
 
213 aa  141  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  38.69 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  38.69 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  40 
 
 
199 aa  139  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  38.1 
 
 
200 aa  134  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  40.33 
 
 
202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  38.59 
 
 
203 aa  131  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  38.74 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  35.96 
 
 
357 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  36.55 
 
 
209 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  40.56 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  37.17 
 
 
194 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  37.3 
 
 
203 aa  122  2e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  34.27 
 
 
195 aa  119  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  36.96 
 
 
358 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  35.68 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  36.7 
 
 
193 aa  115  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  35.33 
 
 
179 aa  114  8.999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  35.36 
 
 
184 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  36.76 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  35.91 
 
 
184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  34.78 
 
 
191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  34.78 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  33.7 
 
 
184 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  34.81 
 
 
196 aa  101  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  36.72 
 
 
196 aa  99.8  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  31.43 
 
 
196 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  31.87 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  29.78 
 
 
201 aa  95.5  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  29.19 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  29.73 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5292  thymidine kinase  30.68 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  28.65 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2705  thymidine kinase  27.37 
 
 
194 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000762715  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  28.57 
 
 
212 aa  59.3  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1971  thymidine kinase  26.4 
 
 
192 aa  58.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0451  thymidine kinase  29.21 
 
 
191 aa  58.5  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003836  thymidine kinase  25 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0878421  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  24.43 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2162  thymidine kinase  28.88 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0016  thymidine kinase  28.88 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  24.43 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2745  thymidine kinase  25.57 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  24.43 
 
 
192 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  24.43 
 
 
192 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2858  thymidine kinase  24 
 
 
186 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0118174  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2861  thymidine kinase  24.43 
 
 
192 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1964  thymidine kinase  25.14 
 
 
196 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2166  thymidine kinase  25.14 
 
 
196 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.856509  normal  0.128361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2073  thymidine kinase  25.14 
 
 
196 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329931  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1410  thymidine kinase  23.86 
 
 
192 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68463  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2178  thymidine kinase  26.34 
 
 
199 aa  55.1  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000221215  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  25.14 
 
 
192 aa  55.1  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  25.7 
 
 
192 aa  55.1  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2468  thymidine kinase  26.34 
 
 
199 aa  55.1  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0799997  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  26.55 
 
 
189 aa  54.7  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1173  thymidine kinase  23.73 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3814  thymidine kinase  28.65 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111719  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2887  thymidine kinase  24.86 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000233672  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01843  thymidine kinase  24.57 
 
 
182 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1449  thymidine kinase  25.7 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000965494  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1357  thymidine kinase  23.3 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.694875  normal  0.123525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1422  thymidine kinase  23.3 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14315  predicted protein  24.48 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1941  thymidine kinase  23.86 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  27.53 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0626  thymidine kinase  24.72 
 
 
200 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2579  thymidine kinase  23.86 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2506  thymidine kinase  24.43 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0736  thymidine kinase  22.73 
 
 
192 aa  52.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00541015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0070  Thymidine kinase  25.42 
 
 
198 aa  52.4  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00429283  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1364  thymidine kinase  27.36 
 
 
195 aa  52  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>