154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0699 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  100 
 
 
223 aa  462  1e-129  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  46 
 
 
205 aa  185  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  45.03 
 
 
207 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  47.89 
 
 
198 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  44.74 
 
 
194 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  48.13 
 
 
199 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  44.97 
 
 
195 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  44.74 
 
 
194 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  44.74 
 
 
194 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  44.74 
 
 
194 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  44.97 
 
 
195 aa  175  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  44.97 
 
 
195 aa  175  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  44.97 
 
 
195 aa  175  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  44.97 
 
 
195 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  45.99 
 
 
199 aa  174  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  45.99 
 
 
199 aa  174  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  45.21 
 
 
195 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  44.21 
 
 
194 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  45.88 
 
 
209 aa  170  1e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  47.87 
 
 
193 aa  168  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  45.41 
 
 
202 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  41.36 
 
 
203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  42.49 
 
 
202 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  41.63 
 
 
229 aa  156  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  43.36 
 
 
358 aa  155  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  43.68 
 
 
198 aa  155  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  43.01 
 
 
219 aa  155  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  42.78 
 
 
200 aa  154  9e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  40.62 
 
 
203 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  47.83 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  45.9 
 
 
190 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  40.4 
 
 
204 aa  145  5e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  41.62 
 
 
357 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  43.23 
 
 
213 aa  142  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  40.21 
 
 
194 aa  142  5e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  41.08 
 
 
193 aa  141  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  43.24 
 
 
194 aa  140  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  40.64 
 
 
193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  42.7 
 
 
214 aa  139  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  42.7 
 
 
184 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  40.76 
 
 
201 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  41.36 
 
 
209 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  40.54 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  36.51 
 
 
191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  38.59 
 
 
185 aa  125  7e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  40.54 
 
 
193 aa  124  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  36.9 
 
 
196 aa  117  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  39.01 
 
 
178 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  37.77 
 
 
201 aa  116  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  37.31 
 
 
186 aa  115  6.9999999999999995e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  34.18 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  36.96 
 
 
187 aa  105  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  34.76 
 
 
179 aa  104  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  37.16 
 
 
184 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  36.61 
 
 
184 aa  102  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  32.81 
 
 
195 aa  99.4  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  34.97 
 
 
196 aa  97.4  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1964  thymidine kinase  32.96 
 
 
196 aa  89.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2166  thymidine kinase  32.96 
 
 
196 aa  89.4  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.856509  normal  0.128361 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5292  thymidine kinase  35.75 
 
 
191 aa  89.4  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2073  thymidine kinase  32.96 
 
 
196 aa  89.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329931  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  32.04 
 
 
212 aa  88.6  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  29.28 
 
 
198 aa  86.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2198  thymidine kinase  29.41 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  30.22 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2283  thymidine kinase  29.61 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1982  thymidine kinase  29.61 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  29.8 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1249  thymidine kinase  30 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  30.6 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0451  thymidine kinase  31.15 
 
 
191 aa  79  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  29.51 
 
 
189 aa  79  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2305  thymidine kinase  30.9 
 
 
204 aa  79  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.494936  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  30.94 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2705  thymidine kinase  30.77 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000762715  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01214  thymidine kinase  29.05 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01224  hypothetical protein  29.05 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1347  thymidine kinase  29.05 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00949382  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0016  thymidine kinase  29.44 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2162  thymidine kinase  29.44 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2411  Thymidine kinase  28.49 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00467829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1724  thymidine kinase  28.49 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.433864  normal  0.600941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1578  thymidine kinase  28.89 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0557569  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2887  thymidine kinase  28.42 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000233672  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1387  thymidine kinase  28.49 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2389  thymidine kinase  28.49 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.375716  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1902  thymidine kinase  28.49 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.354275  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1877  thymidine kinase  28.89 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1940  thymidine kinase  28.89 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0864548  normal  0.836147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1883  thymidine kinase  28.89 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.290604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1395  thymidine kinase  28.89 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.252717  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1403  thymidine kinase  28.49 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63011  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0626  thymidine kinase  28.65 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  29.05 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0792  thymidine kinase  30.43 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.318927  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2745  thymidine kinase  29.44 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2487  thymidine kinase  27.12 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  28.33 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0410  thymidine kinase  28.49 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0070  Thymidine kinase  28.11 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00429283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>