144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1079 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  100 
 
 		 194 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  94.85 
 
 		 193 aa  352  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  68.39 
 
 		 193 aa  264  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  52.11 
 
 		 195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  51.58 
 
 		 194 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  51.58 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  51.58 
 
 		 195 aa  193  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  51.58 
 
 		 195 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  51.58 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  51.58 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  51.58 
 
 		 195 aa  193  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  51.58 
 
 		 195 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  51.87 
 
 		 195 aa  190  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  50 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  52.69 
 
 		 198 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  48.69 
 
 		 198 aa  188  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  52.94 
 
 		 202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  49.73 
 
 		 193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  50.26 
 
 		 229 aa  180  9.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  48.17 
 
 		 205 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  47.87 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  47.87 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  48.17 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  45.5 
 
 		 203 aa  174  5e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  45.26 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  50 
 
 		 200 aa  171  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  50.54 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  43.09 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  43.85 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  48.19 
 
 		 203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  49.21 
 
 		 213 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  42.86 
 
 		 358 aa  155  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  47.45 
 
 		 219 aa  153  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  44.74 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  46.99 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  45.7 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  43.32 
 
 		 357 aa  147  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  48.31 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  47.25 
 
 		 185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  43.81 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  44.74 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  42.93 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  42.08 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  40.54 
 
 		 223 aa  133  9.999999999999999e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  41.45 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  33.69 
 
 		 201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  37.17 
 
 		 194 aa  125  5e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  37.23 
 
 		 184 aa  121  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  36.7 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  35.11 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  36.96 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  32.46 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  36.22 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  35.52 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  42.08 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  40.54 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  34.74 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1964  thymidine kinase  30.22 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2166  thymidine kinase  30.22 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.856509  normal  0.128361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2073  thymidine kinase  30.22 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329931  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  29.08 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  30.39 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  27.22 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  30.98 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  29.44 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2745  thymidine kinase  28.89 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  28.25 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  27.04 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2851  thymidine kinase  27.68 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  28.42 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3814  thymidine kinase  32.22 
 
 		 199 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111719  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  29.51 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2305  thymidine kinase  30.43 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.494936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1173  thymidine kinase  29.94 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03622  thymidine kinase  30.85 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0626  thymidine kinase  27.62 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2705  thymidine kinase  27.47 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000762715  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  27.12 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1449  thymidine kinase  27.53 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000965494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  27.12 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  27.27 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0451  thymidine kinase  25.14 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01214  thymidine kinase  28.26 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01224  hypothetical protein  28.26 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1347  thymidine kinase  28.26 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00949382  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2389  thymidine kinase  28.26 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.375716  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1941  thymidine kinase  26.37 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2411  Thymidine kinase  28.26 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00467829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1387  thymidine kinase  28.26 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1902  thymidine kinase  28.26 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.354275  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1724  thymidine kinase  28.26 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.433864  normal  0.600941 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2887  thymidine kinase  28.04 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000233672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2861  thymidine kinase  26.55 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1357  thymidine kinase  28.41 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.694875  normal  0.123525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1422  thymidine kinase  28.41 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1410  thymidine kinase  28.41 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2579  thymidine kinase  27.12 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0410  thymidine kinase  24.34 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  26.7 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2198  thymidine kinase  28.8 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>