155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2073 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1964  thymidine kinase  100 
 
 		 196 aa  407  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2166  thymidine kinase  100 
 
 		 196 aa  407  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.856509  normal  0.128361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2073  thymidine kinase  100 
 
 		 196 aa  407  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329931  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2705  thymidine kinase  83.85 
 
 		 194 aa  340  8e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000762715  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1982  thymidine kinase  78.95 
 
 		 198 aa  316  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2283  thymidine kinase  78.95 
 
 		 201 aa  316  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2305  thymidine kinase  77.89 
 
 		 204 aa  313  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.494936  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2411  Thymidine kinase  76.44 
 
 		 205 aa  311  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00467829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2389  thymidine kinase  76.44 
 
 		 205 aa  311  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.375716  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1724  thymidine kinase  75.65 
 
 		 205 aa  311  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.433864  normal  0.600941 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1387  thymidine kinase  75.65 
 
 		 205 aa  311  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1902  thymidine kinase  75.65 
 
 		 205 aa  311  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.354275  normal  0.231836 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01214  thymidine kinase  75.13 
 
 		 205 aa  310  9e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01224  hypothetical protein  75.13 
 
 		 205 aa  310  9e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1347  thymidine kinase  75.13 
 
 		 205 aa  310  9e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00949382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1403  thymidine kinase  75.13 
 
 		 205 aa  309  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63011  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0736  thymidine kinase  72.63 
 
 		 192 aa  304  6e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00541015  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1578  thymidine kinase  74.87 
 
 		 205 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0557569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1877  thymidine kinase  74.87 
 
 		 205 aa  302  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1940  thymidine kinase  74.87 
 
 		 205 aa  302  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0864548  normal  0.836147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1883  thymidine kinase  74.87 
 
 		 205 aa  302  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.290604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1395  thymidine kinase  74.87 
 
 		 205 aa  302  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.252717  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  74.74 
 
 		 198 aa  299  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1941  thymidine kinase  71.05 
 
 		 192 aa  297  7e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2198  thymidine kinase  74.87 
 
 		 199 aa  296  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003836  thymidine kinase  72.63 
 
 		 192 aa  295  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0878421  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  70.74 
 
 		 192 aa  295  4e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2745  thymidine kinase  70.21 
 
 		 192 aa  291  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2506  thymidine kinase  70.53 
 
 		 192 aa  291  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1449  thymidine kinase  70.21 
 
 		 192 aa  291  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000965494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2861  thymidine kinase  70 
 
 		 192 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  70.21 
 
 		 192 aa  289  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  69.47 
 
 		 192 aa  289  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  69.47 
 
 		 192 aa  288  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  69.47 
 
 		 192 aa  288  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  69.47 
 
 		 192 aa  288  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1410  thymidine kinase  68.95 
 
 		 192 aa  286  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2851  thymidine kinase  68.95 
 
 		 192 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1357  thymidine kinase  68.42 
 
 		 192 aa  285  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.694875  normal  0.123525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1422  thymidine kinase  68.42 
 
 		 192 aa  285  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2579  thymidine kinase  68.62 
 
 		 192 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0410  thymidine kinase  67.88 
 
 		 195 aa  280  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1173  thymidine kinase  66.32 
 
 		 192 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2887  thymidine kinase  63.35 
 
 		 192 aa  271  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000233672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01843  thymidine kinase  70 
 
 		 182 aa  270  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0685  thymidine kinase  67.38 
 
 		 192 aa  269  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.136148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02627  thymidine kinase  64.17 
 
 		 193 aa  266  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152525  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  64.36 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1971  thymidine kinase  61.58 
 
 		 192 aa  259  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  64.36 
 
 		 209 aa  258  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0626  thymidine kinase  62.63 
 
 		 194 aa  251  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03622  thymidine kinase  58.03 
 
 		 209 aa  245  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0047  thymidine kinase  56.41 
 
 		 206 aa  240  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  0.139333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2641  thymidine kinase  57.67 
 
 		 199 aa  239  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.414214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3277  thymidine kinase  56.38 
 
 		 192 aa  239  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3814  thymidine kinase  59.57 
 
 		 199 aa  238  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111719  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2487  thymidine kinase  56.32 
 
 		 192 aa  236  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2162  thymidine kinase  58.51 
 
 		 196 aa  236  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0016  thymidine kinase  57.98 
 
 		 196 aa  235  4e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0538  thymidine kinase  55.1 
 
 		 197 aa  234  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.113985  normal  0.408144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3324  thymidine kinase  54.21 
 
 		 204 aa  232  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0626  thymidine kinase  54.74 
 
 		 200 aa  229  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3091  thymidine kinase  54.31 
 
 		 200 aa  228  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2822  thymidine kinase  54.31 
 
 		 200 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0513947 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1744  thymidine kinase  57.37 
 
 		 192 aa  218  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622959  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2037  thymidine kinase  51.81 
 
 		 194 aa  191  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.92367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  48.66 
 
 		 189 aa  190  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0451  thymidine kinase  49.2 
 
 		 191 aa  190  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0792  thymidine kinase  49.73 
 
 		 196 aa  188  4e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.318927  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  47.06 
 
 		 189 aa  185  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1249  thymidine kinase  46.63 
 
 		 199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0070  Thymidine kinase  43.39 
 
 		 198 aa  174  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00429283  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4385  thymidine kinase  46.74 
 
 		 197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  44.68 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  44.92 
 
 		 211 aa  165  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2858  thymidine kinase  41.88 
 
 		 186 aa  154  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0118174  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1574  thymidine kinase  43.46 
 
 		 209 aa  141  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.630387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02120  thymidine kinase  41.79 
 
 		 213 aa  138  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5292  thymidine kinase  43.32 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15850  thymidine kinase  39.39 
 
 		 227 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.153347  normal  0.0942863 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12890  thymidine kinase  43.16 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0149  Thymidine kinase  40.1 
 
 		 183 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17490  thymidine kinase  39.57 
 
 		 202 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2468  thymidine kinase  40 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0799997  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2178  thymidine kinase  40 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000221215  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1929  Thymidine kinase  34.45 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.142712  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1697  Thymidine kinase  35.82 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0421472  normal  0.248537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2907  Thymidine kinase  38.14 
 
 		 214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4250  thymidine kinase  37.66 
 
 		 236 aa  115  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266037  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0234  thymidine kinase  38.06 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1625  thymidine kinase  32.55 
 
 		 243 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000168316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2707  Thymidine kinase  34.48 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154523  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1631  thymidine kinase  30.33 
 
 		 239 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0686564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6597  Thymidine kinase  34.21 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2919  thymidine kinase  33.17 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1932  thymidine kinase  32.2 
 
 		 229 aa  104  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23777  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2486  thymidine kinase  32.47 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2930  thymidine kinase  35.9 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00129909  hitchhiker  0.0000388394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3408  thymidine kinase  31.44 
 
 		 239 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21760  thymidine kinase  32.18 
 
 		 230 aa  98.6  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.613703 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>