138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1500 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  100 
 
 		 196 aa  398  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  57.69 
 
 		 184 aa  220  9e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  57.69 
 
 		 184 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  58.38 
 
 		 187 aa  216  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  51.06 
 
 		 195 aa  194  7e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  42.31 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  37.63 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  41.21 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  37.29 
 
 		 213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  35.94 
 
 		 198 aa  128  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  37.08 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  37.24 
 
 		 198 aa  124  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  39.43 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  38.89 
 
 		 194 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  36.55 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  38.33 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  38.89 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  35.94 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  37.97 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  37.78 
 
 		 194 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  37.78 
 
 		 194 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  37.78 
 
 		 195 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  37.78 
 
 		 195 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  37.78 
 
 		 195 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  37.78 
 
 		 194 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  37.78 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  37.78 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  34.62 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  36.96 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  37.14 
 
 		 186 aa  115  6e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  37.85 
 
 		 195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  34.04 
 
 		 219 aa  113  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  37.7 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  36.87 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  32.5 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  36.96 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  36.57 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  36.96 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  35.68 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  34.41 
 
 		 203 aa  111  5e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  33.88 
 
 		 202 aa  107  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  33.52 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  33.52 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  38.04 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  31.84 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  32.42 
 
 		 199 aa  104  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  33.51 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  34.95 
 
 		 358 aa  103  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  34.27 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  33.33 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  38.46 
 
 		 178 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  36.72 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  34.97 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  32.42 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  33.67 
 
 		 357 aa  91.7  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  29.94 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  31.49 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0792  thymidine kinase  29.83 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.318927  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1982  thymidine kinase  29.83 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  28.49 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  30.48 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2283  thymidine kinase  29.28 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2162  thymidine kinase  25.93 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0626  thymidine kinase  25.42 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2641  thymidine kinase  27.12 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.414214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1249  thymidine kinase  25.63 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1964  thymidine kinase  25.81 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5651  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2858  thymidine kinase  27.87 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0118174  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0016  thymidine kinase  25.4 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2166  thymidine kinase  25.81 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.856509  normal  0.128361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2073  thymidine kinase  25.81 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329931  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2487  thymidine kinase  25.7 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0626  thymidine kinase  26.84 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0047  thymidine kinase  21.98 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  0.139333 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  28.04 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  27.96 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0070  Thymidine kinase  25.99 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00429283  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  29.44 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  28.26 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2198  thymidine kinase  27.27 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  28.73 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0451  thymidine kinase  27.62 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2887  thymidine kinase  23.3 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000233672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3324  thymidine kinase  25.14 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2705  thymidine kinase  24.73 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000762715  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3814  thymidine kinase  25.68 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111719  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1971  thymidine kinase  24.08 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03622  thymidine kinase  23.63 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4385  thymidine kinase  26.34 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0538  thymidine kinase  24.86 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.113985  normal  0.408144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  24.04 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  24.04 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2745  thymidine kinase  26.78 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2305  thymidine kinase  25.4 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.494936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2861  thymidine kinase  24.04 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  24.04 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  25.14 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3277  thymidine kinase  24.43 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3091  thymidine kinase  25.7 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02627  thymidine kinase  25.14 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>