78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1329 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  100 
 
 		 197 aa  413  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  81.05 
 
 		 194 aa  327  5.0000000000000004e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  78.06 
 
 		 214 aa  324  5e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  61.58 
 
 		 190 aa  251  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  58.97 
 
 		 204 aa  249  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  62.57 
 
 		 193 aa  245  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  61.9 
 
 		 209 aa  242  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  61.38 
 
 		 201 aa  240  9e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  61.67 
 
 		 213 aa  234  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  52.78 
 
 		 205 aa  197  9e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  53.37 
 
 		 198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  51.4 
 
 		 207 aa  191  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  52.51 
 
 		 194 aa  190  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  50.53 
 
 		 195 aa  189  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  50.53 
 
 		 195 aa  189  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  51.05 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  50.53 
 
 		 195 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  50.53 
 
 		 195 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  50.53 
 
 		 195 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  52.51 
 
 		 194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  50.53 
 
 		 195 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  52.51 
 
 		 194 aa  188  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  52.51 
 
 		 194 aa  188  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  47.4 
 
 		 199 aa  184  8e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  52.51 
 
 		 199 aa  184  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  52.51 
 
 		 199 aa  184  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  50.28 
 
 		 202 aa  181  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  50.86 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  48.35 
 
 		 229 aa  171  6.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  47.72 
 
 		 357 aa  169  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  48.31 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  49.72 
 
 		 193 aa  168  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  48.88 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  45.31 
 
 		 358 aa  160  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  46.37 
 
 		 203 aa  157  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  43.01 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  42.86 
 
 		 203 aa  150  8e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  44.68 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  44.13 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  42.63 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  44.77 
 
 		 194 aa  148  4e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  47.83 
 
 		 223 aa  147  9e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  41.11 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  41.45 
 
 		 194 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  43.02 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  42.47 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  41.11 
 
 		 179 aa  125  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  34.25 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  37.97 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  41.24 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  45.81 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  39.43 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  35.23 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  39.23 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  33.52 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  33.52 
 
 		 184 aa  105  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  33.33 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  28.19 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1971  thymidine kinase  31.82 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  25.93 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03622  thymidine kinase  25.81 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  25.27 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  23.12 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  22.65 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1982  thymidine kinase  23.66 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5292  thymidine kinase  25.7 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14315  predicted protein  29.27 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2283  thymidine kinase  23.5 
 
 		 201 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2641  thymidine kinase  26.77 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.414214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0451  thymidine kinase  23.33 
 
 		 191 aa  45.1  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2198  thymidine kinase  27.68 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0047  thymidine kinase  24.04 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  0.139333 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2887  thymidine kinase  23.08 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000233672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  25.26 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2822  thymidine kinase  25.79 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0513947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3091  thymidine kinase  25.79 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3324  thymidine kinase  28.21 
 
 		 204 aa  41.6  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1173  thymidine kinase  22.47 
 
 		 192 aa  41.2  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>