114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2606 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  100 
 
 		 213 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  66.67 
 
 		 201 aa  250  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  64.37 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  61.67 
 
 		 197 aa  234  5.0000000000000005e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  60.96 
 
 		 190 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  60.56 
 
 		 193 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  62.22 
 
 		 194 aa  231  6e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  60.33 
 
 		 214 aa  228  7e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  58.25 
 
 		 204 aa  225  4e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  56.28 
 
 		 194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  56.28 
 
 		 195 aa  211  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  53.37 
 
 		 186 aa  211  7.999999999999999e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  56.28 
 
 		 194 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  56.28 
 
 		 195 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  56.28 
 
 		 195 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  56.28 
 
 		 194 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  56.28 
 
 		 195 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  56.28 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  56.28 
 
 		 194 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  56.28 
 
 		 194 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  53.97 
 
 		 205 aa  208  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  55.74 
 
 		 195 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  54.64 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  56.59 
 
 		 198 aa  204  9e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  53.26 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  53.67 
 
 		 199 aa  198  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  53.67 
 
 		 199 aa  198  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  51.41 
 
 		 199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  53.8 
 
 		 202 aa  192  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  51.63 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  52.75 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  54.44 
 
 		 200 aa  184  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  46.03 
 
 		 358 aa  184  9e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  51.03 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  48.68 
 
 		 357 aa  176  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  43.08 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  50.54 
 
 		 193 aa  171  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  47.45 
 
 		 202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  49.21 
 
 		 194 aa  161  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  43.85 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  49.49 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  50.81 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  40.68 
 
 		 196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  43.23 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  44.63 
 
 		 194 aa  141  9e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  41.81 
 
 		 201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  45.65 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  44 
 
 		 184 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  42.7 
 
 		 179 aa  134  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  43.26 
 
 		 178 aa  131  9e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  43.58 
 
 		 191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  37.29 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  37.57 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  43.33 
 
 		 196 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  31.77 
 
 		 195 aa  117  9e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  32.96 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  32.96 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0626  thymidine kinase  31.49 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  27.69 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2858  thymidine kinase  27.12 
 
 		 186 aa  62  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0118174  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2162  thymidine kinase  33.93 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0016  thymidine kinase  27.6 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1971  thymidine kinase  28.88 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1249  thymidine kinase  23.81 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14315  predicted protein  31.15 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1964  thymidine kinase  26.98 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2166  thymidine kinase  26.98 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.856509  normal  0.128361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2073  thymidine kinase  26.98 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329931  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  26.02 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1364  thymidine kinase  25.41 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02627  thymidine kinase  26.84 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0070  Thymidine kinase  26.26 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00429283  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2887  thymidine kinase  24.86 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000233672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5292  thymidine kinase  28.09 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2705  thymidine kinase  27.89 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000762715  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4385  thymidine kinase  25.41 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2506  thymidine kinase  33.33 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2579  thymidine kinase  27.27 
 
 		 192 aa  48.5  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2487  thymidine kinase  33.02 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2745  thymidine kinase  27.22 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3814  thymidine kinase  27.47 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111719  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0047  thymidine kinase  29.28 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  0.139333 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  27.07 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  28.65 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1410  thymidine kinase  24.73 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1941  thymidine kinase  29.19 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  24.73 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1357  thymidine kinase  24.73 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.694875  normal  0.123525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1422  thymidine kinase  24.73 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  27.07 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2861  thymidine kinase  26.52 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2851  thymidine kinase  26.2 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  27.07 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0856  thymidine kinase  24.43 
 
 		 163 aa  46.2  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000143946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1449  thymidine kinase  33.01 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000965494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003836  thymidine kinase  28.1 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0878421  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01843  thymidine kinase  33.03 
 
 		 182 aa  45.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  32.71 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2468  thymidine kinase  24.1 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0799997  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2822  thymidine kinase  35.24 
 
 		 200 aa  45.1  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0513947 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>