134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1517 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  100 
 
 		 190 aa  394  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  68.18 
 
 		 193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  61.58 
 
 		 197 aa  251  5.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  60.21 
 
 		 194 aa  243  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  61.46 
 
 		 201 aa  242  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  61.38 
 
 		 214 aa  241  3.9999999999999997e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  64.06 
 
 		 209 aa  239  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  63.43 
 
 		 204 aa  233  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  60.96 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  53.3 
 
 		 202 aa  194  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  51.08 
 
 		 198 aa  192  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  49.73 
 
 		 194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  49.73 
 
 		 194 aa  188  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  49.73 
 
 		 194 aa  188  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  49.73 
 
 		 194 aa  188  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  49.73 
 
 		 195 aa  188  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  49.73 
 
 		 195 aa  188  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  49.73 
 
 		 195 aa  188  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  49.73 
 
 		 195 aa  187  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  49.18 
 
 		 195 aa  186  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  50.56 
 
 		 198 aa  186  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  48.63 
 
 		 194 aa  184  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  49.18 
 
 		 195 aa  184  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  47.78 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  45.25 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  46.67 
 
 		 207 aa  174  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  49.15 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  48.33 
 
 		 193 aa  168  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  49.17 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  47.25 
 
 		 200 aa  167  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  47.46 
 
 		 199 aa  164  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  47.46 
 
 		 199 aa  164  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  47.8 
 
 		 193 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  46.49 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  46.2 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  46.03 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  45.95 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  45.3 
 
 		 357 aa  154  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  48.04 
 
 		 358 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  46.81 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  47.19 
 
 		 194 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  44.69 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  45.7 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  45.9 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  46.99 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  39.89 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  39.33 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  41.44 
 
 		 178 aa  124  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  40.57 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  37.3 
 
 		 191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  40.78 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  38.42 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  36.57 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  33.33 
 
 		 195 aa  106  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  37.08 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  35.43 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  38.5 
 
 		 196 aa  98.6  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  31.72 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  32.26 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1971  thymidine kinase  30.73 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0626  thymidine kinase  30.05 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1941  thymidine kinase  30.81 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02627  thymidine kinase  30.34 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2705  thymidine kinase  29.41 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000762715  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1173  thymidine kinase  28.42 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1982  thymidine kinase  34.05 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0410  thymidine kinase  28.8 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  30.27 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1449  thymidine kinase  28.96 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000965494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2283  thymidine kinase  33.51 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  29.51 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2579  thymidine kinase  27.22 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  28.95 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  29.51 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14315  predicted protein  27.47 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  29.51 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01843  thymidine kinase  30.43 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2198  thymidine kinase  30.77 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003836  thymidine kinase  28.65 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0878421  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0685  thymidine kinase  27.93 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.136148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1964  thymidine kinase  28.88 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2166  thymidine kinase  28.88 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.856509  normal  0.128361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2073  thymidine kinase  28.88 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329931  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  26.92 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2745  thymidine kinase  28.42 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0736  thymidine kinase  29.73 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00541015  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2861  thymidine kinase  27.87 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5292  thymidine kinase  31.11 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  26.78 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2851  thymidine kinase  26.67 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2506  thymidine kinase  28.42 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2887  thymidine kinase  27.89 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000233672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  27.32 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1902  thymidine kinase  28.42 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.354275  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1403  thymidine kinase  27.75 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63011  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1410  thymidine kinase  28.42 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3814  thymidine kinase  28.8 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111719  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1877  thymidine kinase  27.37 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1940  thymidine kinase  27.37 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0864548  normal  0.836147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1883  thymidine kinase  27.37 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.290604 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>