94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4396 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  100 
 
 		 201 aa  421  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  73.33 
 
 		 209 aa  306  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  66.29 
 
 		 213 aa  249  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  61.46 
 
 		 190 aa  242  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  61.38 
 
 		 197 aa  240  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  60.21 
 
 		 194 aa  238  5e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  59.69 
 
 		 214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  57.95 
 
 		 193 aa  226  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  58.29 
 
 		 204 aa  214  9e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  50.52 
 
 		 198 aa  202  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  53.23 
 
 		 198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  52.94 
 
 		 194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  50 
 
 		 205 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  53.07 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  52.49 
 
 		 195 aa  189  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  52.49 
 
 		 195 aa  189  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  50.8 
 
 		 194 aa  188  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  50.8 
 
 		 194 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  50.8 
 
 		 194 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  51.93 
 
 		 195 aa  187  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  50 
 
 		 186 aa  187  7e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  51.93 
 
 		 195 aa  187  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  51.93 
 
 		 195 aa  187  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  50.8 
 
 		 194 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  48.09 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  51.96 
 
 		 195 aa  184  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  48.63 
 
 		 199 aa  184  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  48.63 
 
 		 199 aa  184  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  47.42 
 
 		 207 aa  184  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  50.84 
 
 		 193 aa  179  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  47.62 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  47.51 
 
 		 358 aa  175  4e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  49.17 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  48.09 
 
 		 357 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  47.67 
 
 		 229 aa  168  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  42.93 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  46.81 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  45.9 
 
 		 193 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  45.5 
 
 		 202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  46.99 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  38.58 
 
 		 203 aa  152  4e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  43.01 
 
 		 194 aa  151  7e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  47.83 
 
 		 193 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  40.56 
 
 		 196 aa  137  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  42.31 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  43.5 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  40.76 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  39.89 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  40.78 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  41.11 
 
 		 191 aa  128  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  37.29 
 
 		 187 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  40.78 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  39.43 
 
 		 184 aa  126  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  34.25 
 
 		 184 aa  122  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  34.25 
 
 		 184 aa  121  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  33.33 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  41.01 
 
 		 196 aa  116  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0016  thymidine kinase  29.81 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2162  thymidine kinase  29.81 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  26.2 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0626  thymidine kinase  27.78 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2858  thymidine kinase  26.55 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0118174  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  26.67 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4385  thymidine kinase  26.92 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14315  predicted protein  26.78 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02627  thymidine kinase  26.52 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152525  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1364  thymidine kinase  27.27 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2198  thymidine kinase  24.73 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2861  thymidine kinase  25.84 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2487  thymidine kinase  29.05 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  24.86 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  25.91 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  25.84 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  25.84 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3814  thymidine kinase  24.32 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111719  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2705  thymidine kinase  23.56 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000762715  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1249  thymidine kinase  20.99 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  25.28 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  24.46 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2745  thymidine kinase  23.91 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  22.4 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1449  thymidine kinase  23.03 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000965494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2506  thymidine kinase  23.76 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  21.59 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2579  thymidine kinase  23.5 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3091  thymidine kinase  25.14 
 
 		 200 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2166  thymidine kinase  23.91 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.856509  normal  0.128361 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1964  thymidine kinase  23.91 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5651  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2641  thymidine kinase  24.43 
 
 		 199 aa  42  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.414214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2822  thymidine kinase  25.14 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0513947 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1173  thymidine kinase  22.91 
 
 		 192 aa  42  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2073  thymidine kinase  23.91 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2851  thymidine kinase  22.99 
 
 		 192 aa  41.6  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  21.23 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>