162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1187 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  100 
 
 
184 aa  369  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  82.87 
 
 
185 aa  308  4e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  52.78 
 
 
193 aa  184  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  51.81 
 
 
219 aa  175  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  47.78 
 
 
199 aa  173  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  47.78 
 
 
199 aa  173  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  48.91 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  51.09 
 
 
207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  45.11 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  51.38 
 
 
194 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  51.38 
 
 
195 aa  170  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  51.38 
 
 
194 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  50.83 
 
 
195 aa  169  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  50.83 
 
 
195 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  50.83 
 
 
195 aa  169  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  49.44 
 
 
229 aa  169  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  50.83 
 
 
194 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  50.83 
 
 
195 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  50.83 
 
 
195 aa  168  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  50.28 
 
 
194 aa  167  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  49.72 
 
 
194 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  50 
 
 
202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  51.67 
 
 
200 aa  162  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  46.74 
 
 
198 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  49.44 
 
 
203 aa  160  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  45.76 
 
 
209 aa  160  1e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  47.54 
 
 
202 aa  158  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  50 
 
 
198 aa  157  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  45.6 
 
 
203 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  40.32 
 
 
358 aa  149  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  41.4 
 
 
357 aa  148  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  48.31 
 
 
194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  44.38 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  42.7 
 
 
223 aa  137  6e-32  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  49.16 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  44 
 
 
213 aa  135  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  43.43 
 
 
193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  44.32 
 
 
186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  39.43 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  40.78 
 
 
187 aa  124  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  38.86 
 
 
209 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  40.57 
 
 
190 aa  122  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  42.46 
 
 
184 aa  120  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  42.46 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  40.22 
 
 
204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  41.24 
 
 
178 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  42.08 
 
 
191 aa  115  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  44.57 
 
 
196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  37.43 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  33.88 
 
 
201 aa  114  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  36.87 
 
 
196 aa  114  8.999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  39.43 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  40.34 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  38.29 
 
 
214 aa  107  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  32.63 
 
 
209 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  33.7 
 
 
194 aa  103  2e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  36.26 
 
 
196 aa  101  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  34.64 
 
 
179 aa  100  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0626  thymidine kinase  34.05 
 
 
194 aa  99.4  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  31.72 
 
 
209 aa  99.4  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  34.08 
 
 
192 aa  98.6  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  32.78 
 
 
192 aa  97.8  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  32.96 
 
 
192 aa  97.8  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2861  thymidine kinase  33.15 
 
 
192 aa  97.8  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  32.96 
 
 
192 aa  97.8  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1982  thymidine kinase  34.81 
 
 
198 aa  97.8  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1173  thymidine kinase  35.56 
 
 
192 aa  97.4  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  32.96 
 
 
192 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1410  thymidine kinase  32.78 
 
 
192 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68463  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2283  thymidine kinase  34.81 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  34.64 
 
 
192 aa  95.9  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02627  thymidine kinase  31.89 
 
 
193 aa  95.9  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152525  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1357  thymidine kinase  32.22 
 
 
192 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.694875  normal  0.123525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1422  thymidine kinase  32.22 
 
 
192 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2162  thymidine kinase  34.44 
 
 
196 aa  94.7  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0685  thymidine kinase  31.87 
 
 
192 aa  94.4  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.136148  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2579  thymidine kinase  32.22 
 
 
192 aa  93.6  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2506  thymidine kinase  31.89 
 
 
192 aa  94  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  33.15 
 
 
211 aa  93.2  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2851  thymidine kinase  31.46 
 
 
192 aa  92.8  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0016  thymidine kinase  33.89 
 
 
196 aa  93.2  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2745  thymidine kinase  32.96 
 
 
192 aa  92.4  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  30.56 
 
 
212 aa  90.5  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2887  thymidine kinase  30.53 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000233672  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01843  thymidine kinase  30.56 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1449  thymidine kinase  32.96 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000965494  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1941  thymidine kinase  30.73 
 
 
192 aa  89  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  34.07 
 
 
198 aa  87.8  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2705  thymidine kinase  32.6 
 
 
194 aa  87.8  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000762715  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1971  thymidine kinase  30.56 
 
 
192 aa  87  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  30.51 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5292  thymidine kinase  32.43 
 
 
191 aa  87  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2389  thymidine kinase  32.62 
 
 
205 aa  87  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.375716  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0410  thymidine kinase  29.19 
 
 
195 aa  86.3  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01214  thymidine kinase  31.72 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01224  hypothetical protein  31.72 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1347  thymidine kinase  31.72 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00949382  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1883  thymidine kinase  31.55 
 
 
205 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.290604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1395  thymidine kinase  31.55 
 
 
205 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.252717  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1877  thymidine kinase  31.55 
 
 
205 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>