150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS5179 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  100 
 
 
194 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  100 
 
 
194 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  99.48 
 
 
194 aa  400  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  98.96 
 
 
195 aa  396  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  98.45 
 
 
195 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  97.42 
 
 
194 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  98.45 
 
 
195 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  97.93 
 
 
195 aa  393  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  97.93 
 
 
195 aa  391  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  96.37 
 
 
195 aa  388  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  93.81 
 
 
194 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  76.04 
 
 
205 aa  308  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  71.13 
 
 
207 aa  293  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  65.61 
 
 
199 aa  267  7e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  61.14 
 
 
198 aa  254  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  63.49 
 
 
199 aa  252  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  63.49 
 
 
199 aa  252  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  63.64 
 
 
198 aa  250  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  64.55 
 
 
202 aa  246  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  62.5 
 
 
193 aa  239  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  56.99 
 
 
200 aa  236  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  55.56 
 
 
203 aa  226  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  55.33 
 
 
229 aa  222  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  51.78 
 
 
209 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  56.22 
 
 
202 aa  211  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  56.28 
 
 
213 aa  209  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  49.75 
 
 
357 aa  202  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  51.3 
 
 
358 aa  200  9e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  48.15 
 
 
203 aa  199  3e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  51.79 
 
 
219 aa  195  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  53.3 
 
 
194 aa  195  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  51.58 
 
 
194 aa  193  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  51.1 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  52.51 
 
 
197 aa  188  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  50.83 
 
 
209 aa  188  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  49.73 
 
 
190 aa  188  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  50.8 
 
 
201 aa  188  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  53.89 
 
 
193 aa  187  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  48.92 
 
 
193 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  53.26 
 
 
193 aa  179  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  50 
 
 
204 aa  178  4e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  44.74 
 
 
223 aa  176  2e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  48.13 
 
 
186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  51.38 
 
 
184 aa  171  9e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  50 
 
 
185 aa  169  3e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  43.59 
 
 
194 aa  160  1e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  40.88 
 
 
196 aa  141  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  40.21 
 
 
187 aa  135  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  44.02 
 
 
178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  41.57 
 
 
191 aa  125  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  43.26 
 
 
196 aa  125  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  39.46 
 
 
179 aa  121  8e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  33.69 
 
 
201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  34.92 
 
 
195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  37.78 
 
 
196 aa  118  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  37.77 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  37.77 
 
 
184 aa  116  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1249  thymidine kinase  27.6 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  28.98 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  26.11 
 
 
212 aa  77  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  26.11 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  25 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5292  thymidine kinase  30.9 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  26.55 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02627  thymidine kinase  28.57 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152525  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2745  thymidine kinase  30.11 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0792  thymidine kinase  25 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.318927  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0451  thymidine kinase  23.33 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  26.55 
 
 
209 aa  72  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  28.98 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  28.98 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  28.98 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2162  thymidine kinase  27.12 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2283  thymidine kinase  30.86 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2861  thymidine kinase  28.98 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  28.57 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  28.98 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0016  thymidine kinase  26.55 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1982  thymidine kinase  30.29 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1971  thymidine kinase  28.18 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1964  thymidine kinase  29.71 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2166  thymidine kinase  29.71 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.856509  normal  0.128361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2073  thymidine kinase  29.71 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329931  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2506  thymidine kinase  27.43 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  27.84 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  29.14 
 
 
198 aa  67.8  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1449  thymidine kinase  31.07 
 
 
192 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000965494  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1357  thymidine kinase  27.84 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.694875  normal  0.123525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1422  thymidine kinase  27.84 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1410  thymidine kinase  27.84 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68463  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0685  thymidine kinase  28.98 
 
 
192 aa  67  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.136148  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2858  thymidine kinase  27.17 
 
 
186 aa  67  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0118174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0070  Thymidine kinase  26.11 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00429283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2851  thymidine kinase  27.43 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0626  thymidine kinase  28.57 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0410  thymidine kinase  26.86 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2487  thymidine kinase  26.86 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1173  thymidine kinase  26.29 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3814  thymidine kinase  26.26 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111719  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2579  thymidine kinase  27.84 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>