143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_17990 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  100 
 
 
198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  63.54 
 
 
205 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  61.14 
 
 
194 aa  254  7e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  61.14 
 
 
194 aa  254  7e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  61.14 
 
 
194 aa  254  7e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  65.03 
 
 
198 aa  254  7e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  60.62 
 
 
195 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  63.54 
 
 
207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  60.62 
 
 
195 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  60.62 
 
 
195 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  60.62 
 
 
195 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  62.96 
 
 
193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  60.1 
 
 
194 aa  252  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  60.1 
 
 
194 aa  250  9.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  61.38 
 
 
195 aa  249  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  60.1 
 
 
195 aa  248  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  64.84 
 
 
202 aa  242  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  59.09 
 
 
199 aa  238  5e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  58.08 
 
 
199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  58.08 
 
 
199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  56.93 
 
 
229 aa  232  3e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  58.2 
 
 
200 aa  232  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  58.38 
 
 
203 aa  227  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  56.41 
 
 
357 aa  220  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  56.83 
 
 
202 aa  207  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  53.81 
 
 
219 aa  206  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  50.26 
 
 
209 aa  205  3e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  52.06 
 
 
358 aa  203  1e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  50.53 
 
 
203 aa  202  3e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  53.26 
 
 
213 aa  202  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  50.52 
 
 
201 aa  202  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  49.47 
 
 
209 aa  195  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  52.88 
 
 
193 aa  194  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  48.69 
 
 
194 aa  188  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  50.56 
 
 
190 aa  186  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  50 
 
 
204 aa  182  4.0000000000000006e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  48.33 
 
 
194 aa  181  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  50 
 
 
214 aa  179  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  50.86 
 
 
197 aa  179  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  48.62 
 
 
186 aa  180  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  47.89 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  51.63 
 
 
193 aa  177  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  47.8 
 
 
193 aa  175  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  46.74 
 
 
184 aa  161  6e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  47.25 
 
 
185 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  44.28 
 
 
194 aa  154  7e-37  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  41.53 
 
 
196 aa  138  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  40.96 
 
 
184 aa  136  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  40.96 
 
 
184 aa  136  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  35.94 
 
 
196 aa  128  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  41.08 
 
 
178 aa  125  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  40.74 
 
 
187 aa  125  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  38.92 
 
 
179 aa  122  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  36.81 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  41.99 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  35.83 
 
 
201 aa  116  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  33.69 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  29.26 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  28.57 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  28.65 
 
 
212 aa  67.8  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  28.57 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  28.19 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0626  thymidine kinase  29.55 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  28.41 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1249  thymidine kinase  27.47 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2162  thymidine kinase  27.84 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0792  thymidine kinase  28 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.318927  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5292  thymidine kinase  31.07 
 
 
191 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0016  thymidine kinase  27.27 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1964  thymidine kinase  29.55 
 
 
196 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2166  thymidine kinase  29.55 
 
 
196 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.856509  normal  0.128361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2073  thymidine kinase  29.55 
 
 
196 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329931  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1982  thymidine kinase  28.33 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  27.22 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2283  thymidine kinase  28.33 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02627  thymidine kinase  27.27 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152525  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  29.94 
 
 
192 aa  59.3  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2745  thymidine kinase  31.07 
 
 
192 aa  58.9  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2305  thymidine kinase  30.51 
 
 
204 aa  58.9  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.494936  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2178  thymidine kinase  27.08 
 
 
199 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000221215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  28.98 
 
 
192 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  28.98 
 
 
192 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0070  Thymidine kinase  27.43 
 
 
198 aa  58.9  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00429283  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  28.98 
 
 
192 aa  58.9  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2468  thymidine kinase  27.08 
 
 
199 aa  58.5  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0799997  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  28.98 
 
 
192 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1173  thymidine kinase  29.05 
 
 
192 aa  58.2  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2861  thymidine kinase  29.94 
 
 
192 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2851  thymidine kinase  30.51 
 
 
192 aa  58.2  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  29.38 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0410  thymidine kinase  27.12 
 
 
195 aa  57.8  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2506  thymidine kinase  29.55 
 
 
192 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0451  thymidine kinase  26.29 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2198  thymidine kinase  28.02 
 
 
199 aa  56.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1357  thymidine kinase  29.38 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.694875  normal  0.123525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1422  thymidine kinase  29.38 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1877  thymidine kinase  29.38 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1940  thymidine kinase  29.38 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0864548  normal  0.836147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1883  thymidine kinase  29.38 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.290604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1395  thymidine kinase  29.38 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.252717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>