94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1019 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  100 
 
 
186 aa  382  1e-105  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  53.37 
 
 
213 aa  210  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  55.08 
 
 
198 aa  200  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  50 
 
 
201 aa  187  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  50.55 
 
 
193 aa  186  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  49.74 
 
 
207 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  50.27 
 
 
202 aa  185  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  50.27 
 
 
205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  50.28 
 
 
193 aa  182  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  48.62 
 
 
198 aa  180  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  47.78 
 
 
209 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  45.25 
 
 
190 aa  176  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  49.2 
 
 
194 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  46.6 
 
 
193 aa  175  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  47.37 
 
 
229 aa  174  8e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  47.03 
 
 
199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  48.13 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  48.13 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  48.13 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  48.13 
 
 
195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  47.34 
 
 
200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  47.59 
 
 
194 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  47.59 
 
 
195 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  47.59 
 
 
195 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  47.59 
 
 
195 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  46.28 
 
 
203 aa  171  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  47.59 
 
 
195 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  48.31 
 
 
197 aa  169  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  47.31 
 
 
195 aa  168  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  48.11 
 
 
199 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  48.11 
 
 
199 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  43.85 
 
 
194 aa  165  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  43.01 
 
 
202 aa  162  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  44.44 
 
 
209 aa  158  4e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  42.37 
 
 
204 aa  157  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  43.33 
 
 
214 aa  157  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  44.39 
 
 
193 aa  156  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  42.86 
 
 
203 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  43.85 
 
 
357 aa  154  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  40.84 
 
 
358 aa  154  9e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  42.22 
 
 
194 aa  153  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  45.21 
 
 
219 aa  151  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  44.2 
 
 
196 aa  132  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  44.32 
 
 
184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  41.34 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  40.56 
 
 
194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  39.43 
 
 
187 aa  122  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  36.57 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  36.57 
 
 
184 aa  119  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  33.9 
 
 
196 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  35.56 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  37.14 
 
 
196 aa  115  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  37.31 
 
 
223 aa  115  5e-25  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  35.71 
 
 
191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  37.43 
 
 
179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  35.91 
 
 
178 aa  106  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  30.6 
 
 
195 aa  100  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2887  thymidine kinase  25.28 
 
 
192 aa  58.9  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000233672  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0626  thymidine kinase  28.73 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1249  thymidine kinase  26.46 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2162  thymidine kinase  29.2 
 
 
196 aa  52.4  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0016  thymidine kinase  29.2 
 
 
196 aa  52.4  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02627  thymidine kinase  26.4 
 
 
193 aa  52  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152525  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  23.6 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  23.44 
 
 
211 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  24.58 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  23.63 
 
 
209 aa  48.5  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2745  thymidine kinase  21.91 
 
 
192 aa  48.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2579  thymidine kinase  22.83 
 
 
192 aa  48.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2073  thymidine kinase  20.22 
 
 
196 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329931  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1964  thymidine kinase  20.22 
 
 
196 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2166  thymidine kinase  20.22 
 
 
196 aa  47.8  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.856509  normal  0.128361 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4385  thymidine kinase  23.76 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  22.47 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  22.47 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  22.47 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2487  thymidine kinase  24.29 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2851  thymidine kinase  21.2 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  22.35 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1173  thymidine kinase  24.44 
 
 
192 aa  45.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0685  thymidine kinase  23.6 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.136148  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1357  thymidine kinase  22.35 
 
 
192 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.694875  normal  0.123525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1422  thymidine kinase  22.35 
 
 
192 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1410  thymidine kinase  22.35 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68463  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2861  thymidine kinase  21.91 
 
 
192 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  22.6 
 
 
212 aa  45.1  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1449  thymidine kinase  21.35 
 
 
192 aa  45.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000965494  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1364  thymidine kinase  24.48 
 
 
195 aa  44.7  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  22.53 
 
 
209 aa  44.7  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2506  thymidine kinase  22.47 
 
 
192 aa  44.7  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0792  thymidine kinase  20.44 
 
 
196 aa  44.7  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.318927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  20.79 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  22.35 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0736  thymidine kinase  21.79 
 
 
192 aa  41.2  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00541015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>