44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1364 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1364  thymidine kinase  100 
 
 
195 aa  390  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  28.19 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  25.26 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  24.6 
 
 
184 aa  58.9  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  28.34 
 
 
209 aa  58.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  29.53 
 
 
201 aa  58.2  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  28.95 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  23.2 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  27.27 
 
 
201 aa  54.7  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  27.6 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  29.35 
 
 
194 aa  52.4  0.000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  27.41 
 
 
209 aa  51.6  0.000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  29.02 
 
 
223 aa  51.6  0.000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  22.45 
 
 
194 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  22.68 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  29.23 
 
 
196 aa  50.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  25.91 
 
 
198 aa  48.9  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  26.9 
 
 
203 aa  48.9  0.00004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  21.88 
 
 
193 aa  48.9  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  29.27 
 
 
199 aa  48.5  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  28.19 
 
 
184 aa  48.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  23.16 
 
 
203 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  27.16 
 
 
199 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  27.66 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  23.28 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  27.16 
 
 
199 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  24.49 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  23.74 
 
 
194 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  22.61 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  23.44 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  27.66 
 
 
214 aa  46.2  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14315  predicted protein  40.85 
 
 
196 aa  45.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  26.2 
 
 
194 aa  45.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17490  thymidine kinase  23.23 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110309  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1574  thymidine kinase  22.17 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.630387  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  22.45 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  25.12 
 
 
209 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  22.28 
 
 
200 aa  42.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2178  thymidine kinase  25.51 
 
 
199 aa  41.6  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000221215  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  25.12 
 
 
209 aa  41.6  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2468  thymidine kinase  25.51 
 
 
199 aa  41.6  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0799997  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  29.32 
 
 
195 aa  41.6  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02120  thymidine kinase  22.22 
 
 
213 aa  41.2  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  27.46 
 
 
358 aa  41.2  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>