152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl635 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  100 
 
 
203 aa  417  1e-116  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  62.57 
 
 
209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  50.53 
 
 
198 aa  202  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  50 
 
 
205 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  48.15 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  48.15 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  48.15 
 
 
194 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  48.15 
 
 
194 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  48.15 
 
 
195 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  48.15 
 
 
194 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  48.15 
 
 
195 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  50.26 
 
 
193 aa  199  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  47.62 
 
 
194 aa  198  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  48.15 
 
 
195 aa  197  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  47.62 
 
 
194 aa  195  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  47.62 
 
 
195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  48.15 
 
 
207 aa  194  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  49.73 
 
 
198 aa  194  8.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  48.94 
 
 
199 aa  191  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  47.87 
 
 
199 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  47.87 
 
 
199 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  46.6 
 
 
202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  48.68 
 
 
193 aa  182  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  45.45 
 
 
200 aa  180  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  43.85 
 
 
203 aa  177  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  45.5 
 
 
194 aa  174  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  46.52 
 
 
202 aa  174  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  44.21 
 
 
229 aa  170  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  43.08 
 
 
219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  44.44 
 
 
193 aa  165  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  41.36 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  43.85 
 
 
213 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  43.48 
 
 
357 aa  158  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  45.95 
 
 
190 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  40.22 
 
 
358 aa  156  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  46.41 
 
 
185 aa  155  3e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  43.81 
 
 
194 aa  155  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  42.78 
 
 
209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  45.6 
 
 
184 aa  154  6e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  42.86 
 
 
186 aa  154  6e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  38.58 
 
 
201 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  42.86 
 
 
197 aa  150  8.999999999999999e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  41.4 
 
 
204 aa  149  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  41.24 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  42.25 
 
 
193 aa  145  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  39.47 
 
 
178 aa  124  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  35.29 
 
 
196 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  37.3 
 
 
194 aa  122  3e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  39.27 
 
 
191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  37.97 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  37.43 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  34.76 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  33.68 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  33.68 
 
 
184 aa  112  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  34.41 
 
 
196 aa  111  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  34.74 
 
 
201 aa  106  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  27.66 
 
 
195 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  29.61 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  27.22 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  28.49 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2283  thymidine kinase  29.67 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1982  thymidine kinase  29.67 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  28.49 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  28.96 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  30.73 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2745  thymidine kinase  30.73 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1449  thymidine kinase  29.05 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000965494  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0410  thymidine kinase  27.53 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  29.05 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  29.05 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  29.61 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2178  thymidine kinase  28.57 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000221215  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02627  thymidine kinase  27.53 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2468  thymidine kinase  28.57 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0799997  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2851  thymidine kinase  28.49 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1249  thymidine kinase  27.96 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1877  thymidine kinase  27.03 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1940  thymidine kinase  27.03 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0864548  normal  0.836147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1883  thymidine kinase  27.03 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.290604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1395  thymidine kinase  27.03 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.252717  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0070  Thymidine kinase  28.73 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00429283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1173  thymidine kinase  28.57 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1578  thymidine kinase  26.82 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0557569  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2198  thymidine kinase  28.8 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  28.16 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17490  thymidine kinase  26.34 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110309  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0451  thymidine kinase  26.26 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2858  thymidine kinase  27.07 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0118174  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0626  thymidine kinase  27.78 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1964  thymidine kinase  26.4 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2166  thymidine kinase  26.4 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.856509  normal  0.128361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2073  thymidine kinase  26.4 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329931  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1941  thymidine kinase  27.53 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0016  thymidine kinase  25.56 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2162  thymidine kinase  25.56 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2705  thymidine kinase  26.4 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000762715  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1724  thymidine kinase  25.7 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.433864  normal  0.600941 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2579  thymidine kinase  28 
 
 
192 aa  64.7  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1387  thymidine kinase  25.7 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2389  thymidine kinase  25.7 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.375716  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>