152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1353 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  100 
 
 		 200 aa  403  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  81.25 
 
 		 203 aa  323  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  69.04 
 
 		 219 aa  260  8e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  63.04 
 
 		 193 aa  238  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  56.32 
 
 		 199 aa  236  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  56.99 
 
 		 194 aa  236  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  56.99 
 
 		 194 aa  236  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  56.99 
 
 		 194 aa  236  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  56.99 
 
 		 194 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  56.48 
 
 		 194 aa  235  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  56.48 
 
 		 195 aa  234  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  56.48 
 
 		 195 aa  234  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  56.48 
 
 		 195 aa  234  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  58.2 
 
 		 195 aa  234  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  56.48 
 
 		 195 aa  234  8e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  58.2 
 
 		 198 aa  232  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  57.53 
 
 		 199 aa  231  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  57.53 
 
 		 199 aa  231  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  55.96 
 
 		 195 aa  230  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  57.14 
 
 		 205 aa  225  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  60 
 
 		 198 aa  224  9e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  60.64 
 
 		 207 aa  222  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  52.02 
 
 		 229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  60.54 
 
 		 202 aa  211  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  49.25 
 
 		 357 aa  205  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  44.44 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  53.01 
 
 		 202 aa  186  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  54.44 
 
 		 213 aa  185  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  45.45 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  46.2 
 
 		 358 aa  180  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  47.62 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  50.53 
 
 		 193 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  47.37 
 
 		 209 aa  175  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  47.34 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  50 
 
 		 194 aa  171  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  48.95 
 
 		 194 aa  171  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  47.76 
 
 		 214 aa  171  9e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  47.25 
 
 		 190 aa  167  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  48.9 
 
 		 204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  48.88 
 
 		 197 aa  163  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  46.96 
 
 		 193 aa  162  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  51.67 
 
 		 184 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  53.11 
 
 		 185 aa  160  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  47.54 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  42.78 
 
 		 223 aa  154  7e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  45.25 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  38.1 
 
 		 194 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  37.89 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  38.67 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  41.49 
 
 		 178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  37.37 
 
 		 184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  40.21 
 
 		 187 aa  128  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  34.57 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  35.94 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  45.56 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  33.15 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  38.3 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  33.71 
 
 		 189 aa  84.7  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  33.52 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  30.86 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  30.29 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0792  thymidine kinase  29.14 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.318927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1173  thymidine kinase  32.77 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0451  thymidine kinase  29.14 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  30.39 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  33.15 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  33.15 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  30.51 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0047  thymidine kinase  31.69 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  0.139333 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  30.29 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2851  thymidine kinase  31.07 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0070  Thymidine kinase  30.86 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00429283  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  32.58 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2858  thymidine kinase  28.33 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0118174  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2162  thymidine kinase  33.33 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2861  thymidine kinase  30.51 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1249  thymidine kinase  27.47 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03622  thymidine kinase  35.09 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1982  thymidine kinase  29.44 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1449  thymidine kinase  29.94 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000965494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2705  thymidine kinase  28.98 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000762715  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0016  thymidine kinase  32.77 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2283  thymidine kinase  29.44 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1877  thymidine kinase  31.07 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1940  thymidine kinase  31.07 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0864548  normal  0.836147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1883  thymidine kinase  31.07 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.290604 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02627  thymidine kinase  32.77 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.152525  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1395  thymidine kinase  31.07 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.252717  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1578  thymidine kinase  30.9 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0557569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2198  thymidine kinase  31.87 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  30.39 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  29.14 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  32.02 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0410  thymidine kinase  28.81 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2305  thymidine kinase  32.2 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.494936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1724  thymidine kinase  31.07 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.433864  normal  0.600941 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1387  thymidine kinase  31.07 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1902  thymidine kinase  31.07 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.354275  normal  0.231836 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2411  Thymidine kinase  30.9 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00467829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2389  thymidine kinase  30.9 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.375716  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>