168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3065 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3065  Thymidine kinase  100 
 
 
357 aa  727    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0750  Thymidine kinase  48.4 
 
 
358 aa  330  2e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1726  thymidine kinase  57.73 
 
 
199 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000786711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2155  thymidine kinase  57.58 
 
 
199 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.802514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2193  thymidine kinase  57.58 
 
 
199 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0325826  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0803  Thymidine kinase  54.55 
 
 
198 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000414594  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17990  Thymidine kinase  56.41 
 
 
198 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000417202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3437  thymidine kinase  53.27 
 
 
207 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3326  thymidine kinase  53.27 
 
 
205 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0205376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0091  thymidine kinase  56.02 
 
 
193 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3851  thymidine kinase  51.52 
 
 
194 aa  209  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000141507  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1567  thymidine kinase  46.89 
 
 
229 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5499  thymidine kinase  52.06 
 
 
195 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  unclonable  4.22727e-26 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1353  Thymidine kinase  49.25 
 
 
200 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155048  normal  0.218266 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5457  thymidine kinase  51.55 
 
 
195 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000822691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5422  thymidine kinase  50.25 
 
 
194 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.49713e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5453  thymidine kinase  51.55 
 
 
195 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5014  thymidine kinase  50.5 
 
 
195 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017846  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0578  thymidine kinase  50 
 
 
219 aa  203  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5508  thymidine kinase  50.5 
 
 
195 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5179  thymidine kinase  49.75 
 
 
194 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000576926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5573  thymidine kinase  49.75 
 
 
194 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000067615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5030  thymidine kinase  51.03 
 
 
195 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000581487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5128  thymidine kinase  49.75 
 
 
194 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000156637  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2208  Thymidine kinase  50.52 
 
 
203 aa  200  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0814958  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2667  thymidine kinase  48.73 
 
 
202 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000577182  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0143  thymidine kinase  45.23 
 
 
209 aa  178  1e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2606  Thymidine kinase  48.92 
 
 
213 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4396  Thymidine kinase  48.09 
 
 
201 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1329  thymidine kinase  47.72 
 
 
197 aa  169  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5162  Thymidine kinase  47.54 
 
 
209 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.253504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0586  thymidine kinase  47.28 
 
 
194 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.978781  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02415  thymidine kinase  46.46 
 
 
214 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2828  thymidine kinase  46.81 
 
 
202 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3082  thymidine kinase  44.68 
 
 
193 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  unclonable  0.0000000237469 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl635  thymidine kinase  43.48 
 
 
203 aa  158  1e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0802  Thymidine kinase  44.2 
 
 
193 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1019  thymidine kinase  43.85 
 
 
186 aa  154  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1517  Thymidine kinase  45.3 
 
 
190 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0925  thymidine kinase  45.86 
 
 
204 aa  153  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.646684 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1427  thymidine kinase  43.24 
 
 
185 aa  150  5e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.038514 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1187  thymidine kinase  41.4 
 
 
184 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.712283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1079  thymidine kinase  43.32 
 
 
194 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0699  thymidine kinase  41.62 
 
 
223 aa  145  1e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3804  thymidine kinase  40.86 
 
 
193 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf165  thymidine kinase  35.96 
 
 
194 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.608138  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22350  thymidine kinase  37.97 
 
 
191 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2265  Thymidine kinase  42.55 
 
 
196 aa  119  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474382  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6807  predicted protein  40.22 
 
 
179 aa  119  7e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1047  Thymidine kinase  37.5 
 
 
201 aa  114  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1112  thymidine kinase  36.7 
 
 
178 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0792599  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0798  thymidine kinase  37.5 
 
 
195 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0533  thymidine kinase  38.25 
 
 
184 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0519  thymidine kinase  37.16 
 
 
184 aa  103  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141081  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1206  thymidine kinase  34.78 
 
 
187 aa  95.1  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1760  Thymidine kinase  30.15 
 
 
196 aa  93.2  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.298711 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1500  thymidine kinase  33.67 
 
 
196 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5292  thymidine kinase  32.6 
 
 
191 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1598  thymidine kinase  31.61 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.466684  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0673  thymidine kinase  29.44 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0690  thymidine kinase  28.89 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1249  thymidine kinase  28.88 
 
 
199 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1078  thymidine kinase  28.18 
 
 
189 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0451  thymidine kinase  27.93 
 
 
191 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2162  thymidine kinase  30.56 
 
 
196 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0016  thymidine kinase  29.05 
 
 
196 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0608  thymidine kinase  28.33 
 
 
189 aa  63.9  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1964  thymidine kinase  29.05 
 
 
196 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5651  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2166  thymidine kinase  29.05 
 
 
196 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.856509  normal  0.128361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2073  thymidine kinase  29.05 
 
 
196 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329931  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1785  thymidine kinase  28.64 
 
 
211 aa  60.8  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.563741  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1956  thymidine kinase  29.83 
 
 
198 aa  59.7  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3233  thymidine kinase  27.68 
 
 
192 aa  59.7  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1449  thymidine kinase  29.61 
 
 
192 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000965494  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0410  thymidine kinase  28.73 
 
 
195 aa  58.9  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2198  thymidine kinase  29.83 
 
 
199 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2178  thymidine kinase  27.46 
 
 
199 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000221215  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1516  thymidine kinase  25.99 
 
 
192 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.163762  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2468  thymidine kinase  26.94 
 
 
199 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0799997  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1173  thymidine kinase  30.22 
 
 
192 aa  56.6  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3140  thymidine kinase  27.96 
 
 
192 aa  56.2  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1578  thymidine kinase  27.07 
 
 
205 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0557569  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1883  thymidine kinase  27.07 
 
 
205 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.290604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1395  thymidine kinase  27.07 
 
 
205 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.252717  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1940  thymidine kinase  27.07 
 
 
205 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0864548  normal  0.836147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2705  thymidine kinase  24.73 
 
 
194 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000762715  hitchhiker  0.000803384 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2851  thymidine kinase  28.65 
 
 
192 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.516572  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1877  thymidine kinase  27.07 
 
 
205 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0626  thymidine kinase  29.28 
 
 
194 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2745  thymidine kinase  27.81 
 
 
192 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149787  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0792  thymidine kinase  25.67 
 
 
196 aa  54.7  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.318927  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2283  thymidine kinase  28.18 
 
 
201 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.919388  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1982  thymidine kinase  28.18 
 
 
198 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.333313  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03622  thymidine kinase  26.74 
 
 
209 aa  53.9  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2506  thymidine kinase  25.99 
 
 
192 aa  53.5  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2842  thymidine kinase  25.42 
 
 
192 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2990  thymidine kinase  25.42 
 
 
192 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2536  thymidine kinase  27.53 
 
 
192 aa  53.1  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0993549  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01214  thymidine kinase  25.97 
 
 
205 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01224  hypothetical protein  25.97 
 
 
205 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>