248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2345 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2345  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
146 aa  296  7e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231311  normal  0.0225242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2346  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.61 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0853163  normal  0.0509628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2392  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.36 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.791616 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2301  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.5 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2417  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.68 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.978308  normal  0.103563 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1201  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102813 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  32 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1190  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.09 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.693897  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3016  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.83 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3106  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.83 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0993721  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.06 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0487  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.45 
 
 
137 aa  60.5  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.181601  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2300  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  29.6 
 
 
124 aa  60.1  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.562465  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4449  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.47 
 
 
207 aa  60.1  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  27.78 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0844  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.01 
 
 
183 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0364273 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1943  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.6 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  28.89 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.48 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2614  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3004  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  30.4 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  26.23 
 
 
133 aa  57.8  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3345  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 
134 aa  57.8  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.64 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  25.62 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  25.2 
 
 
136 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2012  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.98 
 
 
219 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.51 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2608  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.51 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2615  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.84 
 
 
218 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  29.77 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0690  biopolymer transport protein  32.8 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0276966  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.03 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  27.78 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.58 
 
 
217 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.4 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880505  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2428  biopolymer transport ExbD like protein  28.12 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.303812 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.38 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.03 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.02 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  27.05 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.69 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.5 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.48 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2402  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.69 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.705571  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0898  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.1 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250835  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.87 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.27 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.6 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4593  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.86 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.46 
 
 
133 aa  55.1  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.45 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4055  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.68 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  29.01 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.6 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.83 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  26.56 
 
 
140 aa  53.5  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.42 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1916  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.98 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0874  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.13 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2269  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  26.98 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.309606  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.6 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.4 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0010  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.84 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041719 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0383  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.13 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0787741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.23 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1012  TonB system transport protein  27.13 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.48 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  27.54 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.65 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.64 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  28.23 
 
 
134 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 
134 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 
134 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.23 
 
 
134 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.23 
 
 
134 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.23 
 
 
134 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.23 
 
 
134 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.41 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  25.41 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1563  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.77 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.48 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.03 
 
 
133 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368012 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2860  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.22 
 
 
226 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070189  hitchhiker  0.000343254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0600  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.23 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.12 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3261  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.22 
 
 
226 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1239  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.79 
 
 
148 aa  50.4  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.371549  normal  0.35298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0150  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.59 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000194485  hitchhiker  0.00605756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2403  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.43 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6111  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  24.59 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>