More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3345 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3345  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 134 aa  263  8e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2428  biopolymer transport ExbD like protein  34.59 
 
 		 148 aa  84.3  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.303812 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.16 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4449  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.59 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0874  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.59 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1012  TonB system transport protein  32.59 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1190  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.693897  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2012  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.73 
 
 		 219 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.46 
 
 		 145 aa  62  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0844  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.41 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0364273 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  27.46 
 
 		 145 aa  62  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.54 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.24 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.94 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.52 
 
 		 135 aa  60.1  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  25 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.47 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  25.62 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  0.00000182227 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  25 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.78 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  25.42 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2860  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.89 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070189  hitchhiker  0.000343254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3261  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.89 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2145  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.13 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.79 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  27.78 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  25.74 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  25.55 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2345  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231311  normal  0.0225242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.88 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.47 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  27.35 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.89 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0487  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.36 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.181601  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.61 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  27.05 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  27.74 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  25.38 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.78 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  28.28 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.21 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.851984 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  26.62 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.01 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2158  TonB system transport protein ExbD  29.51 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0600  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.28 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.91 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  27.12 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.52 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  25.62 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  30.08 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  20.16 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2417  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.81 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.978308  normal  0.103563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.5 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0812  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.6 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  21.64 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3905  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.58 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396754  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  25.62 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1239  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.12 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.371549  normal  0.35298 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  29.82 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  25.4 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  28.57 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.97 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  24.26 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.56 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.73754  normal  0.0224033 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1201  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.4 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102813 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0898  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.06 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.2 
 
 		 154 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.16 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2301  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.2 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  20.97 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.75 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  31.4 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.59 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.21 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  24.62 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  24.79 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  30.58 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.09 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  24.6 
 
 		 152 aa  50.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0355  branched-chain amino acid aminotransferase I  22.66 
 
 		 134 aa  50.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00931363  normal  0.438435 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.59 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  23.85 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11800  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.77 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2615  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.41 
 
 		 218 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4593  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.2 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.35 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.95 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  23.85 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.19 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2346  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.81 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0853163  normal  0.0509628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3016  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.71 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  26.5 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>