276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4575 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 217 aa  425  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2615  biopolymer transport protein ExbD/TolR  62.33 
 
 		 218 aa  240  9e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3261  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.12 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2860  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.12 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070189  hitchhiker  0.000343254 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4449  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.55 
 
 		 207 aa  155  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2012  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.06 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0844  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.88 
 
 		 183 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0364273 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2428  biopolymer transport ExbD like protein  40.41 
 
 		 148 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.303812 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.08 
 
 		 143 aa  81.3  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.43 
 
 		 134 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0487  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.96 
 
 		 137 aa  73.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.181601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2392  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.51 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.791616 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3106  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0993721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3016  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2417  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.27 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.978308  normal  0.103563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  26.4 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  27.61 
 
 		 132 aa  62  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  33.06 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  30.53 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.33 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.73754  normal  0.0224033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  32.23 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  32.23 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.37 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.88 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  30.37 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.38 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.63 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  29.77 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.08 
 
 		 134 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.59 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  29.01 
 
 		 134 aa  57.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.59 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.59 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.59 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  27.2 
 
 		 136 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  26.83 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2346  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 		 145 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0853163  normal  0.0509628 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 		 143 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  26.4 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.88 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.6 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.81 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2345  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.58 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231311  normal  0.0225242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.17 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0443  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.6 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0670  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.6 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  24 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  31.67 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.37 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2608  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.36 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 		 139 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  26.98 
 
 		 150 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.6 
 
 		 140 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  32.52 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  32.52 
 
 		 146 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.91 
 
 		 136 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.58 
 
 		 134 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  34.19 
 
 		 139 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.15 
 
 		 139 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  27.34 
 
 		 134 aa  52.8  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6883  putative TolR protein  30.43 
 
 		 159 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604254  normal  0.0755944 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.81 
 
 		 134 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.81 
 
 		 134 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 		 134 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2919  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 		 134 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0661927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 134 aa  52.4  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  27.27 
 
 		 139 aa  52  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  29.75 
 
 		 147 aa  52  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  29.19 
 
 		 177 aa  52  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  27.69 
 
 		 134 aa  52  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  27.34 
 
 		 134 aa  52  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  26.67 
 
 		 141 aa  52  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.81 
 
 		 134 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  28.93 
 
 		 145 aa  51.6  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001859  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.22 
 
 		 116 aa  51.6  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.62 
 
 		 140 aa  51.6  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0848  TonB system transport protein ExbD  24.59 
 
 		 128 aa  51.6  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000199461  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.78 
 
 		 134 aa  51.6  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1634  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.95 
 
 		 143 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0335583  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  27.34 
 
 		 134 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.03 
 
 		 134 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1052  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.58 
 
 		 156 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0105  TonB system transport protein ExbD, putative  27.2 
 
 		 129 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.664696  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3846  biopolymer transport protein ExbD/TolR family  32.95 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.661546  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.4 
 
 		 135 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.62 
 
 		 134 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  28.46 
 
 		 145 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.58 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.81 
 
 		 134 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  25.76 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  30.58 
 
 		 156 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0117  TonB system transport protein ExbD, putative  27.2 
 
 		 129 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000384782  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  28.33 
 
 		 142 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0145  TonB system transport protein ExbD, putative  27.2 
 
 		 129 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057869  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.81 
 
 		 134 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.81 
 
 		 134 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.41 
 
 		 134 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>