More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27754 on replicon NC_009369
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009369  OSTLU_27754  predicted protein  100 
 
 
359 aa  721    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.953309 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2132  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.65 
 
 
332 aa  89.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.864009 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4308  pseudouridine synthase, RluA family  34.12 
 
 
323 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4177  pseudouridine synthase, RluD  33.97 
 
 
318 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.463318  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1115  pseudouridine synthase, RluA family  34.57 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.494763 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4330  pseudouridine synthase, RluA family  33.65 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2110  pseudouridine synthase  35.17 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1344  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.33 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2377  RluA family pseudouridine synthase  35 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2089  pseudouridylate synthase family protein, yabo  35 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1632  pseudouridine synthase, RluA family  31.71 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0282  RluA family pseudouridine synthase  30.23 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418859  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1353  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.01 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270637  normal  0.743014 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0141  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  37.88 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  37.9 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  37.9 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4321  RluA family pseudouridine synthase  31.65 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.412069 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0522  pseudouridine synthase, RluA family  32.61 
 
 
304 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2253  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.05 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391915  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1481  RluA family pseudouridine synthase  33.05 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00249005  normal  0.0889319 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0345  pseudouridine synthase  31.25 
 
 
226 aa  75.5  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0056  pseudouridine synthase  33.33 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3937  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.3 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000762664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3743  RNA pseudouridylate synthase  37.3 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00315275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3634  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.3 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0043574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3651  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  37.3 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169242  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4031  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  37.3 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00039208  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  30 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0665  hypothetical protein  32.71 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2346  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.31 
 
 
438 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0455755 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3906  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  37.3 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000340417 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3993  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  37.3 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000288046  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1841  pseudouridine synthase, RluA family  32.76 
 
 
431 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.168334 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2414  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  28.08 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3944  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  37.3 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2541  RluA family pseudouridine synthase  34.68 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.15335  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0061  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.61 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102185  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0878  RluA family pseudouridine synthase  34.16 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.175115  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1628  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D protein  33.01 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1686  pseudouridine synthase  38.1 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  27.86 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1704  RluA family pseudouridine synthase  32.49 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225391  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0386  RluA family pseudouridine synthase  38.4 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3127  pseudouridine synthase, RluA family  31.92 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.97 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3518  pseudouridine synthase, RluA family  28.97 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  27.85 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1731  RluA family pseudouridine synthase  32.49 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0967  RluA family pseudouridine synthase  30.8 
 
 
436 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1248  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  36.51 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000362529  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3796  tRNA pseudouridine synthase C  34.19 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000461215 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1014  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  33.33 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000716198  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1777  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.17 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00553261  decreased coverage  0.000101871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3719  RluA family pseudouridine synthase  36.51 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00132143  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6830  pseudouridine synthase, RluA family  31.68 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1288  RluA family pseudouridine synthase  34.65 
 
 
285 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.543506  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0714  23S rRNA pseudouridylate synthase C  31.28 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1817  RluA family pseudouridine synthase  34.34 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.294999 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1032  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.84 
 
 
314 aa  72.4  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.55205  normal  0.0222288 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61490  DRAP deaminase and pseudouridylate synthase  26.92 
 
 
425 aa  72.8  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1084  pseudouridine synthase, RluA family  30.32 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf515  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  26.61 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2627  pseudouridine synthase, RluA family  27.68 
 
 
308 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981062  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5094  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.88 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1256  RluA family pseudouridine synthase  38.58 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0348  RluA family pseudouridine synthase  33.95 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1742  pseudouridine synthase, RluD  28.86 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0441246 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6286  pseudouridine synthase, RluD  34.34 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1591  pseudouridine synthase, RluA family  33.5 
 
 
370 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  decreased coverage  0.00904495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1919  pseudouridine synthase, RluA family  33.5 
 
 
370 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338974  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0069  pseudouridine synthase  35.77 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1281  RluA family pseudouridine synthase  38.58 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.71357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1793  RluA family pseudouridine synthase  34.34 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0803  RluA family pseudouridine synthase  33.57 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0330464  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0763  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.1 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1007  tRNA pseudouridine synthase C  33.57 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228386  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1060  tRNA pseudouridine synthase C  33.57 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2168  RluA family pseudouridine synthase  33.99 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3441  tRNA pseudouridine synthase C  33.57 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1324  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.99 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224168  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  26.94 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2333  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.99 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3401  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.06 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02917  rRNA ribosomal pseudouridine synthase  30.91 
 
 
339 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1084  RluA family pseudouridine synthase  33.99 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.346306  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2644  pseudouridine synthase  35.71 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.263697  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2205  RluA family pseudouridine synthase  33.99 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08290  pseudouridine synthase, RluA family  25.22 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1969  RluA family pseudouridine synthase  34.53 
 
 
541 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.434828  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1813  RluA family pseudouridine synthase  33.99 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587957  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0083  RluA family pseudouridine synthase  33.99 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0777  pseudouridine synthase, RluA family  33.86 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0388  pseudouridine synthase  38.81 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1601  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.5 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000249423  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2197  pseudouridylate synthase  38.4 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1219  pseudouridine synthase, RluA family  29.35 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl387  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase  29.28 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.319286  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002989  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1604  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.85 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0267  tRNA pseudouridine synthase C  34.75 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>