More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2806 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1525  ABC transporter related  67 
 
 		 1176 aa  1373    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.910537 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0744  ABC transporter related protein  63.62 
 
 		 1212 aa  1336    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178425  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3550  ABC transporter related  55.97 
 
 		 1155 aa  1020    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00603168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2806  ABC transporter related  100 
 
 		 1185 aa  2271    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20960  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  60.09 
 
 		 1175 aa  1197    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1357  ABC transporter related  42.02 
 
 		 1218 aa  361  6e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.572904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  30.74 
 
 		 619 aa  215  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.42 
 
 		 597 aa  205  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3551  ABC transporter related  30.21 
 
 		 632 aa  205  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3033  ABC transporter related  32.54 
 
 		 602 aa  204  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3580  ABC transporter related  30.59 
 
 		 607 aa  202  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.85 
 
 		 582 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.34 
 
 		 582 aa  201  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2087  ABC transporter related  30.9 
 
 		 579 aa  200  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  30.89 
 
 		 614 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  31.38 
 
 		 615 aa  198  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.45 
 
 		 608 aa  198  6e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  39.75 
 
 		 636 aa  198  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.85 
 
 		 582 aa  197  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.85 
 
 		 582 aa  197  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.85 
 
 		 582 aa  197  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.85 
 
 		 582 aa  197  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.85 
 
 		 582 aa  197  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  29.85 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.85 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.85 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.85 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.85 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.85 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  29.85 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.85 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.85 
 
 		 582 aa  195  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.21 
 
 		 582 aa  194  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.21 
 
 		 582 aa  194  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.21 
 
 		 582 aa  194  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1494  ABC transporter related protein  36.53 
 
 		 595 aa  193  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.648483  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  34.23 
 
 		 567 aa  193  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.47 
 
 		 582 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  29.79 
 
 		 602 aa  192  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.99 
 
 		 567 aa  191  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.38 
 
 		 614 aa  191  5e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3227  ABC transporter related protein  34.73 
 
 		 609 aa  191  5.999999999999999e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.393011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3978  ABC transporter related protein  33.94 
 
 		 590 aa  191  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  29.66 
 
 		 600 aa  191  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.66 
 
 		 582 aa  191  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0968  ATPase  29.65 
 
 		 592 aa  190  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  36.59 
 
 		 608 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  31.87 
 
 		 600 aa  189  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  39.3 
 
 		 614 aa  189  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.83 
 
 		 582 aa  189  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.8 
 
 		 583 aa  189  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2407  ABC transporter related  34.36 
 
 		 608 aa  188  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  29.21 
 
 		 602 aa  188  6e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.3 
 
 		 582 aa  187  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  32.9 
 
 		 590 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1210  ABC transporter related  29.54 
 
 		 615 aa  187  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2230  ABC transporter related  41.8 
 
 		 593 aa  186  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  27.47 
 
 		 598 aa  186  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3406  ABC transporter related  41.24 
 
 		 593 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169933  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  32.06 
 
 		 765 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06251  putative multidrug efflux ABC transporter  34.07 
 
 		 598 aa  186  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.761119  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  27.73 
 
 		 649 aa  186  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  30.18 
 
 		 592 aa  186  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  27.66 
 
 		 614 aa  186  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  26.64 
 
 		 646 aa  186  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  30.72 
 
 		 591 aa  185  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  38.24 
 
 		 1284 aa  185  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  29.31 
 
 		 619 aa  184  7e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2125  lipid ABC transporter, ATP-binding/permease protein MsbA  28.49 
 
 		 602 aa  182  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153506  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  29.3 
 
 		 661 aa  183  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  27.22 
 
 		 593 aa  183  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5762  ABC transporter related  28.54 
 
 		 589 aa  183  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.59 
 
 		 592 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3180  ABC transporter related  40.34 
 
 		 589 aa  182  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.56 
 
 		 589 aa  182  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  28.09 
 
 		 622 aa  182  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1525  multidrug ABC transporter ATPase/permease  28.41 
 
 		 607 aa  181  5.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024438  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3042  ABC transporter related  30.95 
 
 		 577 aa  181  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708157 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.29 
 
 		 582 aa  181  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1770  ABC transporter related  27.38 
 
 		 610 aa  181  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.686344  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2457  ABC transporter related  31.35 
 
 		 602 aa  181  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.1 
 
 		 1257 aa  181  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.78 
 
 		 579 aa  181  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  32.28 
 
 		 582 aa  181  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  37.96 
 
 		 608 aa  181  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2691  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.49 
 
 		 573 aa  181  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0993753  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  27.72 
 
 		 639 aa  181  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  26.68 
 
 		 598 aa  180  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3070  ABC transporter related  30.06 
 
 		 604 aa  181  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.195979  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5649  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.02 
 
 		 583 aa  180  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  27.83 
 
 		 636 aa  180  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2346  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.02 
 
 		 583 aa  180  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571332  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  38.3 
 
 		 610 aa  180  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  27.15 
 
 		 1218 aa  180  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  38.03 
 
 		 619 aa  181  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  35.23 
 
 		 606 aa  180  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02349  ATP-binding cassette multidrug transport protein ATRC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G2]  26.4 
 
 		 1284 aa  179  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  30.51 
 
 		 677 aa  179  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  32.32 
 
 		 663 aa  179  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.81 
 
 		 594 aa  179  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>